14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1482 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  298  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  40.91 
 
 
156 aa  121  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  46.15 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  47.06 
 
 
153 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  42.21 
 
 
160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  44.87 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  43.87 
 
 
159 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  42.58 
 
 
158 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  41.29 
 
 
158 aa  103  7e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  43.15 
 
 
156 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  38 
 
 
160 aa  97.1  7e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  39.35 
 
 
154 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  38 
 
 
159 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  28.3 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>