14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2236 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  320  7e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  52.9 
 
 		 160 aa  175  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  48.32 
 
 		 158 aa  147  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  45.39 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  43.42 
 
 		 160 aa  137  7e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  43.71 
 
 		 156 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  45.58 
 
 		 156 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  45.7 
 
 		 159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  43.42 
 
 		 158 aa  127  8.000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  46.98 
 
 		 154 aa  120  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  40.4 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  41.72 
 
 		 153 aa  120  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  38 
 
 		 153 aa  98.2  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0447  protein of unknown function DUF474  26.62 
 
 		 149 aa  44.7  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>