17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3172 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  100 
 
 		 153 aa  292  1e-78  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  73.03 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  61.84 
 
 		 160 aa  185  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  63.82 
 
 		 154 aa  165  2e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  54.73 
 
 		 160 aa  156  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  52.53 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  52.63 
 
 		 159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  44.37 
 
 		 160 aa  136  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  52.94 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  49.34 
 
 		 158 aa  135  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  47.06 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  47.68 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  41.72 
 
 		 159 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3627  hypothetical protein  33.73 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105374  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  34.91 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  27.64 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  27.64 
 
 		 159 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>