25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1035 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  321  2e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  52.29 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  50.98 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  52.9 
 
 		 159 aa  160  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  43.79 
 
 		 156 aa  137  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  45.1 
 
 		 156 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  42.21 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  43.33 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  43.42 
 
 		 158 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  41.56 
 
 		 159 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  44.37 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  43.14 
 
 		 154 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  38 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  33.96 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3627  hypothetical protein  21.48 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105374  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  38.1 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  29.61 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  29.61 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  27.52 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  45.83 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  27.63 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  28.95 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>