55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2276 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 152 aa  291  2e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  98.68 
 
 		 152 aa  289  7e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  93.42 
 
 		 152 aa  278  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  92.11 
 
 		 152 aa  276  9e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  92.11 
 
 		 152 aa  276  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  92.11 
 
 		 152 aa  276  9e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  92.11 
 
 		 152 aa  276  9e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  92.11 
 
 		 152 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  94.08 
 
 		 152 aa  275  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  90.79 
 
 		 152 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  95.39 
 
 		 152 aa  256  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  95.39 
 
 		 152 aa  255  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  95.39 
 
 		 152 aa  255  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  95.39 
 
 		 152 aa  255  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  80.92 
 
 		 152 aa  248  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  79.61 
 
 		 152 aa  245  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  91.54 
 
 		 130 aa  238  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  78.95 
 
 		 152 aa  226  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  49.32 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  44.14 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  44.6 
 
 		 159 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  44.6 
 
 		 159 aa  103  8e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  42.07 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  45.59 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  46.15 
 
 		 158 aa  97.4  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  45 
 
 		 155 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  42.57 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  43.26 
 
 		 154 aa  91.7  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  43.15 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  43.15 
 
 		 154 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  46.26 
 
 		 153 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  40.16 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  40.74 
 
 		 158 aa  86.3  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  43.94 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  41.1 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  42.55 
 
 		 154 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  34.42 
 
 		 150 aa  84  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  41.22 
 
 		 160 aa  82.4  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  42.97 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  44.53 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  42.97 
 
 		 155 aa  80.1  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  41.01 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  41.78 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  35.42 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  33.11 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  42.11 
 
 		 154 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  40.31 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  27.97 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  33.68 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  27.52 
 
 		 160 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  36.61 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>