61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0247 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  278  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  81.2 
 
 		 160 aa  191  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  50.36 
 
 		 153 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  45.59 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  45.59 
 
 		 152 aa  111  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  46.27 
 
 		 152 aa  110  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  45.59 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  45.59 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  45.59 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  45.59 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  44.85 
 
 		 152 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  45.59 
 
 		 152 aa  110  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  45.52 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  45.59 
 
 		 152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  42.76 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  46.15 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  46.15 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  46.15 
 
 		 152 aa  99.4  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  44.92 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  43.08 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  44.07 
 
 		 152 aa  96.7  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  44.63 
 
 		 130 aa  94.7  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  42.54 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  38.1 
 
 		 159 aa  94  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  37.41 
 
 		 159 aa  91.7  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  40.69 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  40.43 
 
 		 158 aa  84  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  40.69 
 
 		 154 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  40.69 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  41.67 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  38.76 
 
 		 155 aa  80.9  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  38.93 
 
 		 158 aa  80.5  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  38.69 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  39.31 
 
 		 154 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  36.5 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  42.11 
 
 		 154 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  39.29 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  40.88 
 
 		 153 aa  77  0.00000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  37.32 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  35.07 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  38.62 
 
 		 154 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  41.01 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  42.98 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  32.17 
 
 		 154 aa  72  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  32.85 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  39.85 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  33.83 
 
 		 150 aa  67.4  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  36.21 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  39.01 
 
 		 154 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1897  hypothetical protein  35.62 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.400946  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2155  copper resistance D  38.24 
 
 		 164 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.976167  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  29.58 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  28.74 
 
 		 697 aa  44.3  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  37.68 
 
 		 160 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  27.61 
 
 		 186 aa  41.2  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  36.36 
 
 		 547 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  34.85 
 
 		 547 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  34.85 
 
 		 549 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  26.26 
 
 		 927 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  34.85 
 
 		 544 aa  40  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>