16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1897 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1897  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  320  6e-87  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.400946  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1666  hypothetical protein  29.22 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.149845  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  26.76 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  47.4  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  23.84 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  23.84 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  23.84 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  23.84 
 
 
152 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  23.18 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  24.48 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  28.57 
 
 
152 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  28.57 
 
 
152 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  28.57 
 
 
152 aa  42  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  28.17 
 
 
147 aa  41.6  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  24.48 
 
 
152 aa  41.2  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  23.18 
 
 
152 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>