13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2795 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2795  hypothetical protein  100 
 
 
146 aa  277  4e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4251  hypothetical protein  69.66 
 
 
145 aa  192  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.215178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3242  hypothetical protein  62.76 
 
 
145 aa  174  4e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3627  hypothetical protein  60.71 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105374  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0502  hypothetical protein  55.32 
 
 
145 aa  134  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24703 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0447  protein of unknown function DUF474  30.82 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136192  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4061  hypothetical protein  31.48 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2155  copper resistance D  32.11 
 
 
164 aa  48.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.976167  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1279  protein of unknown function DUF474  28.37 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352216  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  44.12 
 
 
697 aa  44.7  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2288  copper resistance D  34.91 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.600323  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  28.97 
 
 
158 aa  41.6  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  28.71 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>