151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1332 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1332  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  363  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  47.59 
 
 
182 aa  152  2e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  46.07 
 
 
184 aa  147  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  43.86 
 
 
194 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0938  hypothetical protein  44.77 
 
 
183 aa  134  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  47.26 
 
 
203 aa  132  3.9999999999999996e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  40.94 
 
 
187 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  39.56 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  40.94 
 
 
187 aa  127  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  40.45 
 
 
197 aa  125  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  43.92 
 
 
175 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03675  hypothetical protein  42.13 
 
 
182 aa  118  3.9999999999999996e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  42.67 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  41.67 
 
 
195 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  42.67 
 
 
190 aa  114  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  43.33 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  40.26 
 
 
186 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  42 
 
 
195 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0329  hypothetical protein  46.67 
 
 
187 aa  107  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.541566  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  39.2 
 
 
188 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  39.01 
 
 
188 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  39.44 
 
 
188 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10021  hypothetical protein  47.68 
 
 
187 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.764651  normal  0.386426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  36.55 
 
 
141 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  36.55 
 
 
141 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  36.88 
 
 
139 aa  90.9  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  35.86 
 
 
141 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  35.86 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  37.16 
 
 
148 aa  89.7  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  33.8 
 
 
140 aa  88.6  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  34.01 
 
 
143 aa  88.2  6e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  38.76 
 
 
140 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  38.76 
 
 
140 aa  87  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  86.3  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  33.79 
 
 
143 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  34.04 
 
 
142 aa  86.7  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  35.14 
 
 
141 aa  84.3  7e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  38.17 
 
 
140 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  33.79 
 
 
142 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  38.17 
 
 
140 aa  83.6  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  35.37 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  34.9 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  34.46 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  34.04 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  34.48 
 
 
142 aa  82.4  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  34 
 
 
145 aa  82.4  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  37.59 
 
 
142 aa  82  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  34.23 
 
 
151 aa  82  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  33.1 
 
 
178 aa  81.3  0.000000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1714  transmembrane protein  34 
 
 
148 aa  80.1  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.722222  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  31.76 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  34.35 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  36.17 
 
 
140 aa  79  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  32.65 
 
 
150 aa  79  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  33.59 
 
 
142 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  32.41 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  33.1 
 
 
146 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  32.67 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  38.64 
 
 
136 aa  77.8  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  32.89 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  36.57 
 
 
178 aa  76.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  32.62 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  35.38 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  30.34 
 
 
177 aa  75.9  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  31.21 
 
 
142 aa  76.3  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  33.59 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  35.2 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  30.5 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  32.17 
 
 
148 aa  75.1  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  33.59 
 
 
142 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  30.13 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  32.05 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  35.56 
 
 
179 aa  73.9  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  30.13 
 
 
165 aa  73.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  37.32 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  35.43 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  32.54 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  32.64 
 
 
140 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  31.21 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  33.33 
 
 
139 aa  73.6  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  28.97 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  32.62 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  28.97 
 
 
150 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  28.97 
 
 
150 aa  71.2  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0745  flagellin  33.1 
 
 
144 aa  71.2  0.000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  28.28 
 
 
141 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  29.66 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  31.79 
 
 
141 aa  70.9  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  34.65 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  32.84 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  35.29 
 
 
144 aa  68.9  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0027  hypothetical protein  28.47 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  68.2  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  31.54 
 
 
138 aa  67  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  31.03 
 
 
151 aa  67  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  30.56 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  29.53 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  31.16 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>