151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2862 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  306  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  60.4 
 
 		 148 aa  187  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  60.71 
 
 		 165 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  60 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  60 
 
 		 165 aa  179  1e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  58.16 
 
 		 145 aa  175  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  48.61 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  48.61 
 
 		 146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  45.71 
 
 		 149 aa  120  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  46.48 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  43.97 
 
 		 143 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  47.18 
 
 		 144 aa  117  6e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  45.24 
 
 		 149 aa  111  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  42.96 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  45.21 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  43.57 
 
 		 178 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  43.14 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  42.96 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  42.25 
 
 		 178 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  43.57 
 
 		 143 aa  107  7.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  107  8.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  42.96 
 
 		 143 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  43.57 
 
 		 178 aa  106  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  42.96 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  42.96 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  42.96 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  41.78 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  43.57 
 
 		 178 aa  104  4e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  42.58 
 
 		 146 aa  103  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  41.84 
 
 		 141 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  40.94 
 
 		 148 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  39.86 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  42.14 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  35.14 
 
 		 151 aa  99.4  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  41.26 
 
 		 141 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  41.86 
 
 		 178 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  40.43 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0115  hypothetical protein  42.14 
 
 		 170 aa  91.3  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  39.37 
 
 		 179 aa  90.9  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  39.58 
 
 		 195 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  36.23 
 
 		 149 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  36.88 
 
 		 150 aa  89.4  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  39.37 
 
 		 180 aa  89.4  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  39.37 
 
 		 142 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  38.03 
 
 		 142 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  36.17 
 
 		 142 aa  87  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  33.1 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1332  hypothetical protein  34.23 
 
 		 181 aa  82  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  36.11 
 
 		 168 aa  80.9  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  39.01 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  35 
 
 		 171 aa  79.7  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  38.1 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  39.53 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  37.24 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  36.88 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0027  hypothetical protein  37.14 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  42.97 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  42.97 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  37.01 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  35.92 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  36.22 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  33.85 
 
 		 143 aa  77.4  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  29.73 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  34.13 
 
 		 144 aa  76.6  0.0000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  36.72 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  35.61 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1714  transmembrane protein  37.41 
 
 		 148 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.722222  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  39.68 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  31.34 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5018  hypothetical protein  33.77 
 
 		 154 aa  74.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0850066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  35.61 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  38.89 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  32.41 
 
 		 194 aa  74.3  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  39.31 
 
 		 203 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  34.53 
 
 		 139 aa  73.9  0.0000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  30.46 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  34.04 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  36.05 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  31.13 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  30.46 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  34.56 
 
 		 136 aa  72  0.000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  41.27 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  36.55 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  33.81 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  36.69 
 
 		 142 aa  71.6  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  33.79 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  36.09 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  34.03 
 
 		 175 aa  70.5  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  33.79 
 
 		 187 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  34.88 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  33.79 
 
 		 187 aa  70.5  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  34.72 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  36.73 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  34.88 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  34.48 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  32.28 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  38.36 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  34.06 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0745  flagellin  32.37 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  32.47 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>