155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0628 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  343  5e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0115  hypothetical protein  65.68 
 
 
170 aa  236  2e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  62.41 
 
 
140 aa  174  4e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  53.97 
 
 
142 aa  152  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  48.25 
 
 
149 aa  144  5e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0745  flagellin  46.85 
 
 
144 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1714  transmembrane protein  47.55 
 
 
148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.722222  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  45.83 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  45.83 
 
 
150 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  45.14 
 
 
150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0027  hypothetical protein  41.38 
 
 
147 aa  110  7.000000000000001e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  40.85 
 
 
148 aa  108  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  40 
 
 
141 aa  101  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  43.26 
 
 
141 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  43.26 
 
 
141 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  42.4 
 
 
142 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  41.13 
 
 
143 aa  98.6  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  37.58 
 
 
182 aa  98.2  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  43.26 
 
 
141 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  43.26 
 
 
141 aa  98.6  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  37.59 
 
 
142 aa  95.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  38.81 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  38.81 
 
 
187 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  39.72 
 
 
142 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  39.01 
 
 
178 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  38.46 
 
 
178 aa  92.8  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  37.76 
 
 
146 aa  92.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  40.56 
 
 
144 aa  92  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  40.71 
 
 
148 aa  91.3  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  39.86 
 
 
144 aa  90.9  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  36.11 
 
 
146 aa  90.9  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  37.06 
 
 
144 aa  90.1  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  36.81 
 
 
148 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  40.14 
 
 
177 aa  89.7  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  34.75 
 
 
149 aa  89.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  34.76 
 
 
194 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  37.41 
 
 
143 aa  89  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  36.57 
 
 
197 aa  89  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  40.65 
 
 
140 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  36.69 
 
 
140 aa  88.2  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  39.68 
 
 
140 aa  87.8  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  36.62 
 
 
165 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  35.62 
 
 
146 aa  87.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  39.2 
 
 
142 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  34.55 
 
 
187 aa  87.4  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  35.66 
 
 
149 aa  85.9  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  85.1  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  37.59 
 
 
141 aa  85.5  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  34.48 
 
 
145 aa  84.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  39.2 
 
 
142 aa  84.3  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  37.19 
 
 
140 aa  83.6  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  37.19 
 
 
140 aa  84  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  36.36 
 
 
178 aa  84  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  37.3 
 
 
178 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  34.35 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  35.46 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  35.66 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  35.66 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  35.66 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  35.46 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  34.88 
 
 
143 aa  80.1  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  34.4 
 
 
140 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  34.51 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  37.76 
 
 
180 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  34.51 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  35 
 
 
151 aa  79.7  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  34.75 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  35.34 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  36.43 
 
 
143 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  33.83 
 
 
190 aa  78.6  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  34.53 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  30.72 
 
 
168 aa  76.6  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  33.81 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  33.81 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  35.92 
 
 
139 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  33.8 
 
 
151 aa  75.9  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  33.59 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  35.21 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  34.57 
 
 
195 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  34.51 
 
 
138 aa  74.7  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  32.35 
 
 
148 aa  73.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  33.08 
 
 
190 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  34.51 
 
 
138 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  37.14 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  32.91 
 
 
184 aa  72.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  31.65 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  35.77 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  32.19 
 
 
140 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  72  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  32.19 
 
 
140 aa  72  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  32.19 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  36.51 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  36.88 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  30.34 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  30.99 
 
 
140 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  32.85 
 
 
141 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  34.03 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  32.37 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1248  hypothetical protein  31.58 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  32.88 
 
 
142 aa  69.7  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>