165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4259 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  93.26 
 
 
178 aa  323  8.000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  74.01 
 
 
180 aa  246  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  56.74 
 
 
178 aa  214  4e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  56.74 
 
 
178 aa  214  5e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  59.41 
 
 
177 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  53.93 
 
 
178 aa  210  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  59.66 
 
 
179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  58.16 
 
 
146 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  57.14 
 
 
140 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  55.41 
 
 
146 aa  175  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  57.75 
 
 
143 aa  175  3e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  60.28 
 
 
144 aa  174  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  56.03 
 
 
146 aa  174  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  58.74 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  58.74 
 
 
146 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  57.55 
 
 
139 aa  170  1e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  58.04 
 
 
146 aa  169  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  56.83 
 
 
140 aa  168  4e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  56.83 
 
 
143 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  55 
 
 
141 aa  165  4e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  56.43 
 
 
141 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  56.43 
 
 
148 aa  162  3e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  55 
 
 
141 aa  157  6e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  53.57 
 
 
143 aa  153  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  51.06 
 
 
148 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  52.08 
 
 
141 aa  140  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  52.08 
 
 
141 aa  140  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  52.08 
 
 
141 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  52.08 
 
 
141 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  48.95 
 
 
140 aa  134  7.000000000000001e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  47.79 
 
 
136 aa  129  2.0000000000000002e-29  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  53.62 
 
 
137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  49.29 
 
 
142 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  47.14 
 
 
149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  49.65 
 
 
139 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  46.48 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  47.89 
 
 
142 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  51.75 
 
 
142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  43.06 
 
 
145 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  48.92 
 
 
149 aa  124  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  45.77 
 
 
165 aa  124  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  45.07 
 
 
165 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  44.76 
 
 
151 aa  122  3e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  52.11 
 
 
142 aa  121  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  50.72 
 
 
137 aa  121  6e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  46.81 
 
 
142 aa  120  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  50.7 
 
 
142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  43.06 
 
 
141 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  45.07 
 
 
142 aa  118  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  45.52 
 
 
150 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  48.65 
 
 
144 aa  115  3e-25  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  47.97 
 
 
144 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  41.3 
 
 
168 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  39.31 
 
 
150 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  41.13 
 
 
149 aa  112  3e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  39.31 
 
 
150 aa  112  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  44.2 
 
 
141 aa  112  4.0000000000000004e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  46.1 
 
 
140 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  45.71 
 
 
148 aa  111  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  39.31 
 
 
150 aa  111  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  46.48 
 
 
140 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  38.19 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  43.57 
 
 
141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  47.52 
 
 
140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  47.52 
 
 
140 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  41.13 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  42.25 
 
 
151 aa  107  8.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  46.85 
 
 
142 aa  106  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  41.26 
 
 
194 aa  105  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  45 
 
 
140 aa  105  5e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  45 
 
 
140 aa  104  7e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  43.06 
 
 
140 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  42.36 
 
 
138 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  42.55 
 
 
142 aa  102  4e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  41.61 
 
 
149 aa  101  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  45.59 
 
 
136 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  46.76 
 
 
139 aa  100  8e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  41.67 
 
 
138 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  38.46 
 
 
187 aa  99.4  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  38.69 
 
 
144 aa  99  3e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  46.04 
 
 
139 aa  98.6  4e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  40.97 
 
 
140 aa  97.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  41.96 
 
 
146 aa  97.4  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  42.96 
 
 
195 aa  97.4  9e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  39.16 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  39.58 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  39.58 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  39.58 
 
 
140 aa  96.3  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  41.55 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  41.38 
 
 
144 aa  95.9  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  39.58 
 
 
140 aa  95.5  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  39.58 
 
 
140 aa  95.5  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  45 
 
 
144 aa  94.4  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  38.17 
 
 
187 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  41.91 
 
 
190 aa  94  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  42.36 
 
 
140 aa  93.6  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  42.66 
 
 
147 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  42.66 
 
 
147 aa  93.6  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  38.78 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.879523 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>