159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0119 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  278  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  56.12 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  54.74 
 
 
149 aa  159  1e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  51.08 
 
 
143 aa  134  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  46.1 
 
 
141 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  43.57 
 
 
178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  46.1 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  45.32 
 
 
178 aa  121  4e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  43.17 
 
 
178 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  43.17 
 
 
178 aa  118  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  46.43 
 
 
146 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  43.57 
 
 
146 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  43.57 
 
 
146 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  42.14 
 
 
143 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  43.57 
 
 
178 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  42.14 
 
 
177 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  44.52 
 
 
145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  43.17 
 
 
144 aa  110  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  40.58 
 
 
141 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  42.96 
 
 
141 aa  108  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  42.96 
 
 
141 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  42.96 
 
 
141 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  46.76 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  42.14 
 
 
165 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  43.48 
 
 
136 aa  106  9.000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  42.86 
 
 
146 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  43.17 
 
 
146 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  41.43 
 
 
165 aa  105  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  42.25 
 
 
141 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  40.71 
 
 
165 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  40.71 
 
 
140 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  37.86 
 
 
148 aa  105  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  42.55 
 
 
143 aa  104  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  41.73 
 
 
139 aa  103  7e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  41.43 
 
 
180 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  40.29 
 
 
140 aa  102  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  44.06 
 
 
142 aa  99.4  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  41.96 
 
 
142 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  41.01 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  40.15 
 
 
187 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  40.15 
 
 
187 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  43.57 
 
 
148 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  39.01 
 
 
151 aa  93.6  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  39.01 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1332  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  93.2  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  43.88 
 
 
149 aa  92  3e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  40.77 
 
 
203 aa  91.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  38.57 
 
 
140 aa  90.9  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  44.76 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  35.86 
 
 
194 aa  90.5  7e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  44.76 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  39.29 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  43.08 
 
 
190 aa  89.4  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  37.59 
 
 
149 aa  89.4  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  39.44 
 
 
141 aa  89  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  37.88 
 
 
197 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  38.46 
 
 
182 aa  88.2  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  40.69 
 
 
184 aa  87  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  38.41 
 
 
168 aa  87  9e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  39.53 
 
 
190 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  35.86 
 
 
187 aa  86.7  1e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  39.57 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  43.17 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  38.1 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  38.85 
 
 
139 aa  85.5  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  42.55 
 
 
140 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  38.1 
 
 
150 aa  85.5  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  37.06 
 
 
151 aa  84.7  4e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  41.84 
 
 
140 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  37.41 
 
 
150 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  39.44 
 
 
142 aa  84.3  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0027  hypothetical protein  38.19 
 
 
147 aa  84  6e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  39.58 
 
 
140 aa  84  7e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  39.58 
 
 
140 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  39.16 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0115  hypothetical protein  41.84 
 
 
170 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  38.57 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  39.29 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1714  transmembrane protein  38.13 
 
 
148 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.722222  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  37.24 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  38.36 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  36.49 
 
 
142 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  37.21 
 
 
195 aa  77.4  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  32.19 
 
 
186 aa  77  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  37.59 
 
 
171 aa  76.6  0.00000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  35.71 
 
 
148 aa  75.5  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  35.86 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  36.43 
 
 
186 aa  75.5  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  35 
 
 
141 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0745  flagellin  34.29 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  36.36 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  37.14 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  32.26 
 
 
188 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  37.14 
 
 
140 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  40.58 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5018  hypothetical protein  35 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0850066  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  31.45 
 
 
188 aa  72.8  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  31.45 
 
 
188 aa  71.6  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  39.29 
 
 
137 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>