167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4772 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  290  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  97.16 
 
 
141 aa  285  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  96.45 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  96.45 
 
 
141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  73.94 
 
 
142 aa  220  6e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  80.28 
 
 
142 aa  217  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  69.72 
 
 
142 aa  214  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  73.24 
 
 
142 aa  209  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  73.94 
 
 
142 aa  207  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  77.86 
 
 
140 aa  206  8e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  77.86 
 
 
140 aa  206  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  66.19 
 
 
140 aa  189  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  65.22 
 
 
139 aa  184  3e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  60.99 
 
 
141 aa  180  6e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  66.43 
 
 
144 aa  177  4.999999999999999e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  67.14 
 
 
144 aa  176  8e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  59.85 
 
 
141 aa  170  5e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  62.14 
 
 
140 aa  166  9e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  54.74 
 
 
168 aa  163  9e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  63.77 
 
 
144 aa  159  1e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  52.86 
 
 
148 aa  150  5e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  50 
 
 
148 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  55.71 
 
 
140 aa  142  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  52.41 
 
 
141 aa  142  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  59.12 
 
 
139 aa  142  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  52.45 
 
 
140 aa  140  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  47.55 
 
 
146 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  51.43 
 
 
140 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  51.43 
 
 
140 aa  140  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  58.27 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  52.08 
 
 
178 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  59.85 
 
 
137 aa  139  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  50.34 
 
 
143 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  57.55 
 
 
140 aa  138  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  49.29 
 
 
144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  50.34 
 
 
145 aa  138  1.9999999999999998e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  45.83 
 
 
146 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  57.66 
 
 
139 aa  138  3e-32  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  53.72 
 
 
172 aa  138  3e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  51.37 
 
 
141 aa  138  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  50 
 
 
178 aa  137  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  59.42 
 
 
137 aa  137  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  49.29 
 
 
143 aa  137  3.9999999999999997e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  46.1 
 
 
140 aa  137  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  47.14 
 
 
146 aa  137  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  46.53 
 
 
146 aa  136  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  47.86 
 
 
178 aa  136  8.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  47.86 
 
 
178 aa  136  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  47.52 
 
 
143 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  50.35 
 
 
143 aa  134  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  49.64 
 
 
141 aa  133  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  49.3 
 
 
177 aa  133  8e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  46.1 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  59.57 
 
 
140 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  46.1 
 
 
146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  55.71 
 
 
140 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  50.35 
 
 
165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  49.65 
 
 
165 aa  127  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  52.78 
 
 
178 aa  127  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  49.65 
 
 
165 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  54.41 
 
 
136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  44.29 
 
 
139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  51.05 
 
 
144 aa  125  3e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  47.1 
 
 
138 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  42.86 
 
 
140 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  50.72 
 
 
142 aa  123  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  46.81 
 
 
149 aa  122  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  48.57 
 
 
149 aa  122  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  46.1 
 
 
140 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  46.38 
 
 
141 aa  120  4e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  46.53 
 
 
195 aa  120  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  46.1 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  45.65 
 
 
138 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  45.65 
 
 
141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  43.97 
 
 
140 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  43.97 
 
 
140 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  43.97 
 
 
140 aa  118  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  44.9 
 
 
140 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  44.83 
 
 
184 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  43.97 
 
 
140 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  43.26 
 
 
140 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  52.52 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  42.07 
 
 
194 aa  114  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  47.52 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  50.35 
 
 
142 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  45.45 
 
 
142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  44.29 
 
 
148 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  45.39 
 
 
140 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  45.39 
 
 
147 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  45.39 
 
 
147 aa  110  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  45.39 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  45.39 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  47.26 
 
 
146 aa  110  7.000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  42.55 
 
 
140 aa  110  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  44.59 
 
 
186 aa  110  9e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  45.77 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  49.31 
 
 
142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  45.65 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  45.65 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  45.65 
 
 
138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>