164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1862 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  293  4e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  97.92 
 
 
144 aa  273  5e-73  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  78.47 
 
 
144 aa  217  3.9999999999999997e-56  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  66.43 
 
 
141 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  67.14 
 
 
141 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  66.43 
 
 
141 aa  192  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  66.43 
 
 
141 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  60.87 
 
 
142 aa  179  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  60.14 
 
 
140 aa  175  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  62.32 
 
 
142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  56.52 
 
 
142 aa  170  5.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  61.59 
 
 
142 aa  169  9e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  61.59 
 
 
142 aa  167  5e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  58.09 
 
 
141 aa  164  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  62.14 
 
 
140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  62.14 
 
 
140 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  53.57 
 
 
141 aa  155  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  55.8 
 
 
139 aa  148  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  50 
 
 
168 aa  140  8e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  53.57 
 
 
140 aa  139  9.999999999999999e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  52.52 
 
 
140 aa  129  9e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  44.83 
 
 
178 aa  129  9e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  53.28 
 
 
137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  47.48 
 
 
177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  47.97 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  53.62 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  52.55 
 
 
140 aa  127  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  51.82 
 
 
140 aa  127  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  52.9 
 
 
139 aa  127  7.000000000000001e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  42.07 
 
 
178 aa  127  8.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  42.07 
 
 
178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  46.26 
 
 
148 aa  124  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  45.71 
 
 
140 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  45.71 
 
 
140 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  42.66 
 
 
144 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  54.68 
 
 
137 aa  123  9e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  43.75 
 
 
148 aa  123  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  43.45 
 
 
143 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  45.07 
 
 
146 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  41.38 
 
 
146 aa  121  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  43.15 
 
 
146 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  45.32 
 
 
141 aa  120  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  43.15 
 
 
146 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  40.28 
 
 
149 aa  120  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  45 
 
 
140 aa  120  7e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  43.97 
 
 
143 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  51.09 
 
 
136 aa  120  9e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  49.19 
 
 
172 aa  119  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  38.62 
 
 
146 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  39.58 
 
 
146 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  43.26 
 
 
140 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  45.32 
 
 
141 aa  117  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  48.57 
 
 
140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  44.68 
 
 
144 aa  115  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  43.66 
 
 
141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  41.84 
 
 
143 aa  114  5e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  47.86 
 
 
178 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  47.86 
 
 
140 aa  113  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  39.58 
 
 
145 aa  113  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  41.73 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  42.07 
 
 
149 aa  110  8.000000000000001e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  41.3 
 
 
140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  41.38 
 
 
140 aa  106  8.000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  39.86 
 
 
138 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  38.41 
 
 
140 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  39.13 
 
 
138 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  41.43 
 
 
139 aa  105  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  39.86 
 
 
140 aa  104  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  41.67 
 
 
194 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  40.28 
 
 
165 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  41.13 
 
 
140 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  37.68 
 
 
140 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  37.68 
 
 
140 aa  103  7e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  42.86 
 
 
142 aa  103  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  37.68 
 
 
140 aa  102  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  37.68 
 
 
140 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  43.88 
 
 
148 aa  102  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  44.06 
 
 
143 aa  102  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  36.96 
 
 
140 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  43.66 
 
 
142 aa  100  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  44.6 
 
 
142 aa  100  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  43.06 
 
 
180 aa  100  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  40.71 
 
 
179 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  42.36 
 
 
150 aa  98.6  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  38.19 
 
 
165 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  38.19 
 
 
165 aa  99.4  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  42.36 
 
 
150 aa  98.6  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  42.34 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  42.36 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  37.41 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  44.2 
 
 
137 aa  97.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  39.86 
 
 
171 aa  97.8  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  39.13 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  39.13 
 
 
147 aa  96.7  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  39.13 
 
 
140 aa  96.7  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  44.14 
 
 
142 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  38.31 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  39.13 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  39.13 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  39.13 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>