157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0258 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  281  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  81.56 
 
 		 141 aa  222  1e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  61.03 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  64.49 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  64.49 
 
 		 140 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  62.32 
 
 		 140 aa  161  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  60.29 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  58.7 
 
 		 140 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  57.97 
 
 		 140 aa  156  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  57.25 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  57.25 
 
 		 140 aa  156  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  57.25 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  60.14 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  57.97 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  56.52 
 
 		 140 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  59.29 
 
 		 144 aa  154  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  57.25 
 
 		 140 aa  155  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  59.29 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  59.29 
 
 		 147 aa  154  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  62.32 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  59.42 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  59.42 
 
 		 140 aa  153  9e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  59.56 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  59.56 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  59.56 
 
 		 138 aa  152  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  60.14 
 
 		 140 aa  149  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  61.43 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0193  hypothetical protein  61.43 
 
 		 142 aa  144  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0263  hypothetical protein  60 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0112116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0268  hypothetical protein  60 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476461 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  59.29 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4925  hypothetical protein  59.29 
 
 		 142 aa  139  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000715814  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  55 
 
 		 142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  54.48 
 
 		 146 aa  134  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  53.57 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  50 
 
 		 137 aa  126  9.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  44.93 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  44.93 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  45.65 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  42.55 
 
 		 148 aa  117  3.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  44.93 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  50.74 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  47.06 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0381  hypothetical protein  54.62 
 
 		 131 aa  114  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.314635  normal  0.174306 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  43.88 
 
 		 168 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  43.36 
 
 		 142 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  42.36 
 
 		 142 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  47.48 
 
 		 142 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  47.45 
 
 		 137 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  44.6 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  47.48 
 
 		 140 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  43.06 
 
 		 142 aa  103  8e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  46.76 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  42.36 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  44.93 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  41.26 
 
 		 140 aa  101  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  39.13 
 
 		 141 aa  100  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1248  hypothetical protein  42.28 
 
 		 151 aa  97.8  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  39.57 
 
 		 140 aa  97.1  7e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  40.15 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  40.41 
 
 		 143 aa  95.5  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  37.96 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  35.86 
 
 		 178 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  40.41 
 
 		 203 aa  92  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  44.53 
 
 		 137 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  38.36 
 
 		 178 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  40.14 
 
 		 143 aa  90.9  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01813  hypothetical protein  42.76 
 
 		 148 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0118637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  33.33 
 
 		 148 aa  87.4  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  38.36 
 
 		 194 aa  86.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  38.57 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  37.06 
 
 		 178 aa  84.7  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  37.06 
 
 		 178 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  39.44 
 
 		 140 aa  84  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  30.82 
 
 		 149 aa  83.6  8e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  44.29 
 
 		 140 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  41.67 
 
 		 195 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  44.29 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  37.5 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  35.86 
 
 		 178 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  38.19 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  35.92 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  37.58 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1325  hypothetical protein  43.09 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0175884  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  34.78 
 
 		 142 aa  82  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  33.56 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  38.21 
 
 		 172 aa  81.6  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  33.33 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  37.41 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0172  hypothetical protein  39.73 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445067  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  32.41 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0151  hypothetical protein  39.04 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  35.37 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  35.21 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  33.57 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  34.51 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>