156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0391 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  100 
 
 
140 aa  281  2.0000000000000002e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  62.41 
 
 
171 aa  174  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0115  hypothetical protein  53.9 
 
 
170 aa  150  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  55.24 
 
 
142 aa  145  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1714  transmembrane protein  53.24 
 
 
148 aa  144  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.722222  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  48.23 
 
 
149 aa  143  6e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  47.18 
 
 
150 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  47.18 
 
 
150 aa  136  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  46.48 
 
 
150 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0027  hypothetical protein  49.29 
 
 
147 aa  127  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0745  flagellin  45 
 
 
144 aa  123  9e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  43.88 
 
 
143 aa  116  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  43.26 
 
 
141 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  39.57 
 
 
143 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  42.14 
 
 
140 aa  112  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  42.55 
 
 
141 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  42.55 
 
 
141 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  41.84 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  39.57 
 
 
146 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  41.13 
 
 
178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  42.14 
 
 
178 aa  107  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  42.55 
 
 
177 aa  105  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  39.57 
 
 
148 aa  105  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  41.26 
 
 
142 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  42.14 
 
 
149 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  40.29 
 
 
144 aa  105  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  40.71 
 
 
178 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  40.43 
 
 
146 aa  104  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  40.43 
 
 
146 aa  104  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  38.17 
 
 
141 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  36.69 
 
 
146 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  40 
 
 
146 aa  103  9e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  40.71 
 
 
178 aa  103  9e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  36.43 
 
 
146 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  37.59 
 
 
140 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  40.14 
 
 
142 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  39.29 
 
 
140 aa  102  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  40.97 
 
 
143 aa  100  8e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  36.11 
 
 
141 aa  99.8  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  41.55 
 
 
142 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  43.97 
 
 
140 aa  99  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  40.71 
 
 
143 aa  98.6  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  37.14 
 
 
148 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  38.57 
 
 
141 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  43.97 
 
 
140 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  44.76 
 
 
142 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  38.46 
 
 
194 aa  97.1  7e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  39.57 
 
 
141 aa  97.1  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  39.29 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  41.96 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  41.38 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  41.55 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  44.76 
 
 
178 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  40.58 
 
 
142 aa  95.5  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  38.41 
 
 
139 aa  94.4  4e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  41.84 
 
 
140 aa  94.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  39.16 
 
 
187 aa  94.4  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  38.57 
 
 
141 aa  94  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  40.88 
 
 
137 aa  92.8  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  41.26 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  37.69 
 
 
187 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  37.69 
 
 
187 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  35.97 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  35.97 
 
 
140 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  37.59 
 
 
138 aa  90.5  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  38.73 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  38.41 
 
 
141 aa  89.7  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  36.23 
 
 
168 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  40 
 
 
180 aa  89.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  41.48 
 
 
140 aa  89  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  35.46 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  35.46 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  35.46 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  36.17 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  41.48 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  35.46 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  36.17 
 
 
140 aa  87.4  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  36.88 
 
 
138 aa  87.4  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  37.32 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  37.69 
 
 
197 aa  87.4  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  40.88 
 
 
137 aa  86.7  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  34.75 
 
 
140 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  35.66 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  38.46 
 
 
182 aa  84.3  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  38.57 
 
 
140 aa  84.3  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  40.71 
 
 
179 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  38.35 
 
 
136 aa  84.3  5e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  34.53 
 
 
140 aa  84  7e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  34.53 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  36.36 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  39.29 
 
 
141 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  33.8 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  36.36 
 
 
146 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  36.88 
 
 
140 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  32.61 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  36.89 
 
 
172 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  36.17 
 
 
140 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  36.17 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  36.17 
 
 
138 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>