160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2844 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  300  4.0000000000000003e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  58.33 
 
 
150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  54.74 
 
 
141 aa  139  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  43.07 
 
 
178 aa  108  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  43.07 
 
 
178 aa  107  6e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  40.88 
 
 
143 aa  105  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  38.24 
 
 
140 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  40.44 
 
 
144 aa  105  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  39.42 
 
 
178 aa  104  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  37.96 
 
 
143 aa  104  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  39.42 
 
 
146 aa  102  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  39.42 
 
 
177 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  39.42 
 
 
146 aa  102  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  39.16 
 
 
146 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  41.61 
 
 
178 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  37.96 
 
 
141 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  37.93 
 
 
165 aa  100  9e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  38.89 
 
 
148 aa  99.8  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  37.93 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  36.24 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  37.24 
 
 
165 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  36.91 
 
 
146 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  37.23 
 
 
141 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  38.57 
 
 
145 aa  97.1  7e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  34.9 
 
 
146 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  36.03 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  38.41 
 
 
141 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  35.29 
 
 
140 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  41.61 
 
 
178 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  36.88 
 
 
151 aa  92  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  39.13 
 
 
141 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  37.23 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  38.41 
 
 
141 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  41.96 
 
 
142 aa  90.5  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  36.55 
 
 
148 aa  90.5  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  36.03 
 
 
143 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  38.41 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  36.23 
 
 
151 aa  89  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  35.71 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  35.51 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  39.57 
 
 
142 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  37.23 
 
 
180 aa  83.6  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1332  hypothetical protein  34.04 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  37.59 
 
 
142 aa  82  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  35.82 
 
 
136 aa  80.5  0.000000000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  38.19 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  36.64 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  34.56 
 
 
148 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  39.72 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  40.85 
 
 
144 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  39.16 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5018  hypothetical protein  34.27 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0850066  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  38.57 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  29.14 
 
 
148 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  34.53 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  34.53 
 
 
142 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  36.72 
 
 
195 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  38.28 
 
 
142 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  34.78 
 
 
141 aa  70.9  0.000000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  31.91 
 
 
194 aa  70.1  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  36.22 
 
 
203 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  39.2 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  37.06 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  38.03 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  33.1 
 
 
187 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  31.69 
 
 
195 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  38.4 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  32.39 
 
 
168 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  36.22 
 
 
140 aa  67.4  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  35.16 
 
 
190 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  30.94 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  31.94 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  34.45 
 
 
142 aa  65.1  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  38.58 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  31.93 
 
 
144 aa  64.7  0.0000000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  32.28 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  30.87 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0329  hypothetical protein  33.33 
 
 
187 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.541566  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  30.89 
 
 
188 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  32.87 
 
 
175 aa  63.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  30.89 
 
 
188 aa  63.2  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  30.71 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  30.08 
 
 
188 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  30.71 
 
 
187 aa  62.8  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  36.88 
 
 
139 aa  62  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  34.11 
 
 
190 aa  60.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  34.29 
 
 
139 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  43.75 
 
 
137 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  37.67 
 
 
142 aa  60.1  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  35.46 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  34.72 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  30.5 
 
 
182 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0938  hypothetical protein  33.79 
 
 
183 aa  58.9  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  34.42 
 
 
146 aa  58.2  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  58.2  0.00000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10021  hypothetical protein  34.07 
 
 
187 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.764651  normal  0.386426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  30.5 
 
 
138 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  33.09 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  33.09 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  28.75 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>