163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3754 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  373  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  52 
 
 		 182 aa  179  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0938  hypothetical protein  48.6 
 
 		 183 aa  167  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  45.76 
 
 		 175 aa  160  1e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03675  hypothetical protein  44.63 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1332  hypothetical protein  46.07 
 
 		 181 aa  147  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  40.88 
 
 		 194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  40.98 
 
 		 186 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  42.7 
 
 		 203 aa  128  4.0000000000000003e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  39.23 
 
 		 187 aa  123  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  46.04 
 
 		 139 aa  123  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  40.54 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  45.52 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  44.83 
 
 		 141 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  40.54 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  44.83 
 
 		 141 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0329  hypothetical protein  44.44 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.541566  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  44.83 
 
 		 141 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  42.31 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  41.76 
 
 		 188 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  41.76 
 
 		 188 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  37.14 
 
 		 187 aa  114  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  37.14 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  39.56 
 
 		 190 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  39.33 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  36.16 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  45.38 
 
 		 186 aa  111  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  44.52 
 
 		 142 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  37.64 
 
 		 168 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10021  hypothetical protein  46.91 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.764651  normal  0.386426 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  45.67 
 
 		 140 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  44.88 
 
 		 140 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  42.97 
 
 		 140 aa  99.8  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  41.78 
 
 		 142 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  39.31 
 
 		 141 aa  98.6  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  39.2 
 
 		 143 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  43.44 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  37.76 
 
 		 143 aa  91.3  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  39.69 
 
 		 142 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  43.97 
 
 		 140 aa  89  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  41.22 
 
 		 142 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  37.06 
 
 		 148 aa  87.4  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  44.35 
 
 		 139 aa  87.8  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  40 
 
 		 145 aa  87.4  9e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  44.35 
 
 		 139 aa  87  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  40.46 
 
 		 142 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  84.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  41.5 
 
 		 178 aa  84.7  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  38.58 
 
 		 137 aa  84  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  36.73 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  36.69 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  40.69 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  34.97 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  38.21 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  38.19 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  33.79 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  35.17 
 
 		 140 aa  80.5  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  35.37 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  36.36 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  40.94 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  40.94 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  37.24 
 
 		 151 aa  79  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  37.93 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  37.24 
 
 		 165 aa  78.6  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  37.93 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  35.25 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  36.69 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  35.66 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  39.42 
 
 		 142 aa  77.4  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  32.41 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  32.89 
 
 		 141 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  39.16 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  40.62 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  34.53 
 
 		 146 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  34.97 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  35.76 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  39.84 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  33.57 
 
 		 146 aa  74.7  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  34.69 
 
 		 142 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  37.25 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  40.8 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  32.91 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  40.3 
 
 		 178 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  32.45 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  35.25 
 
 		 142 aa  72.4  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  32.45 
 
 		 146 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  34.67 
 
 		 178 aa  72  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  36.43 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  31.58 
 
 		 146 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  35.25 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  35.92 
 
 		 140 aa  70.5  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  34.69 
 
 		 177 aa  70.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0745  flagellin  30.77 
 
 		 144 aa  70.1  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  36.81 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  36.11 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  34.44 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  32.41 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  31.29 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>