154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0307 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  100 
 
 		 142 aa  279  7.000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  78.72 
 
 		 146 aa  222  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  68.31 
 
 		 144 aa  198  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  73.24 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4925  hypothetical protein  72.54 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000715814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0268  hypothetical protein  70.42 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476461 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0263  hypothetical protein  70.42 
 
 		 142 aa  186  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0112116  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  69.01 
 
 		 142 aa  181  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0193  hypothetical protein  69.01 
 
 		 142 aa  180  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  71.13 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  66.2 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  64.08 
 
 		 140 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  64.08 
 
 		 140 aa  173  9e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  64.08 
 
 		 140 aa  164  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  64.79 
 
 		 140 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  59.15 
 
 		 138 aa  158  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  59.86 
 
 		 140 aa  156  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  59.15 
 
 		 140 aa  156  9e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  59.15 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  59.15 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  59.15 
 
 		 140 aa  155  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  58.45 
 
 		 138 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  58.45 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  59.15 
 
 		 140 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  58.45 
 
 		 140 aa  153  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  57.75 
 
 		 147 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  57.75 
 
 		 147 aa  150  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  57.75 
 
 		 140 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  57.75 
 
 		 140 aa  149  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  57.75 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  57.75 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  57.75 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  58.45 
 
 		 140 aa  148  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0381  hypothetical protein  63.08 
 
 		 131 aa  142  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.314635  normal  0.174306 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  55.63 
 
 		 138 aa  140  4e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  53.57 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  58.45 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  54.93 
 
 		 137 aa  130  6e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  52.86 
 
 		 141 aa  120  7e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  50.7 
 
 		 142 aa  120  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  50.69 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  47.59 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  45.39 
 
 		 141 aa  113  6.9999999999999995e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  45.45 
 
 		 140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  46.9 
 
 		 141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  46.9 
 
 		 141 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  46.9 
 
 		 141 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  42.55 
 
 		 148 aa  110  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  53.15 
 
 		 137 aa  110  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  50.68 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  46.9 
 
 		 142 aa  108  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  51.72 
 
 		 137 aa  104  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  48.95 
 
 		 140 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  48.25 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  43.57 
 
 		 142 aa  100  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  47.18 
 
 		 142 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  46.48 
 
 		 142 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  40.97 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  42.76 
 
 		 168 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  40.97 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  42.55 
 
 		 141 aa  99  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1248  hypothetical protein  45.58 
 
 		 151 aa  98.6  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  40.97 
 
 		 146 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  42.25 
 
 		 142 aa  98.2  3e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  50.35 
 
 		 142 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  42.47 
 
 		 178 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  42.96 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  41.96 
 
 		 177 aa  89.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  39.58 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  40.14 
 
 		 144 aa  86.7  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  39.01 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  40.85 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  45.21 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  35.42 
 
 		 143 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  39.16 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  36.62 
 
 		 146 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  38.89 
 
 		 141 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  38.03 
 
 		 143 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01813  hypothetical protein  40.69 
 
 		 148 aa  84.3  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0118637  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  39.58 
 
 		 178 aa  84.3  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  36.36 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  37.41 
 
 		 178 aa  82  0.000000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  37.41 
 
 		 178 aa  81.6  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1325  hypothetical protein  39.37 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0175884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  35.42 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  41.26 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  41.26 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  34.51 
 
 		 146 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  35.92 
 
 		 139 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  41.27 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  36.88 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  33.1 
 
 		 140 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  36.55 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  34.25 
 
 		 140 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  37.59 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  35.86 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  38.62 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  35.25 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  34.48 
 
 		 175 aa  73.9  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  34.48 
 
 		 148 aa  73.6  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>