157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2969 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_2969  hypothetical protein  100 
 
 		 140 aa  276  5e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2740  hypothetical protein  82.86 
 
 		 140 aa  230  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2979  hypothetical protein  79.29 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2569  hypothetical protein  79.29 
 
 		 140 aa  226  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.83321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2830  hypothetical protein  89.29 
 
 		 140 aa  225  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179032  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  71.43 
 
 		 140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  70 
 
 		 140 aa  193  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  70.71 
 
 		 138 aa  193  6e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0246  hypothetical protein  67.61 
 
 		 144 aa  191  3e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.163595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0328  hypothetical protein  72.54 
 
 		 142 aa  191  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.038975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  68.57 
 
 		 140 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  69.29 
 
 		 140 aa  190  5e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  68.57 
 
 		 140 aa  190  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  68.57 
 
 		 140 aa  190  6e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  69.29 
 
 		 138 aa  190  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  67.86 
 
 		 140 aa  187  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  67.14 
 
 		 140 aa  187  5e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1215  hypothetical protein  68.57 
 
 		 140 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.34192  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4925  hypothetical protein  71.13 
 
 		 142 aa  178  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000715814  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0263  hypothetical protein  68.31 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0112116  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0268  hypothetical protein  68.31 
 
 		 142 aa  177  4e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000476461 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0193  hypothetical protein  69.01 
 
 		 142 aa  177  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.115967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  67.14 
 
 		 147 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  67.14 
 
 		 147 aa  176  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  67.14 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  67.14 
 
 		 140 aa  176  9e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  67.14 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  67.14 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  67.14 
 
 		 138 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  69.72 
 
 		 142 aa  173  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3804  hypothetical protein  66.9 
 
 		 142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000216317  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  62.32 
 
 		 141 aa  169  9e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0307  putative transmembrane protein  64.79 
 
 		 142 aa  166  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  61.7 
 
 		 146 aa  162  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0236  hypothetical protein  63.04 
 
 		 141 aa  160  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  55.71 
 
 		 141 aa  156  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  57.14 
 
 		 142 aa  156  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  55.71 
 
 		 141 aa  154  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  55 
 
 		 141 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  55 
 
 		 141 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  58.87 
 
 		 140 aa  152  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2425  transmembrane protein  58.57 
 
 		 137 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  61.43 
 
 		 136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0381  hypothetical protein  65.65 
 
 		 131 aa  144  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.314635  normal  0.174306 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  61.7 
 
 		 137 aa  142  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  55.32 
 
 		 139 aa  142  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  52.78 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  55.71 
 
 		 142 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  55 
 
 		 142 aa  140  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  57.86 
 
 		 140 aa  138  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  57.45 
 
 		 142 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  57.14 
 
 		 140 aa  136  8.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  51.8 
 
 		 141 aa  136  1e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0281  hypothetical protein  57.75 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.440714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  49.28 
 
 		 168 aa  131  3e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  58.57 
 
 		 140 aa  130  6.999999999999999e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  49.64 
 
 		 141 aa  128  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  44.6 
 
 		 148 aa  124  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  49.29 
 
 		 140 aa  124  5e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  57.45 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  53.9 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  53.9 
 
 		 140 aa  121  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  47.86 
 
 		 144 aa  120  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  48.55 
 
 		 142 aa  121  4e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  48.57 
 
 		 144 aa  120  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  50 
 
 		 139 aa  111  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  50 
 
 		 139 aa  110  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  43.57 
 
 		 142 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  41.43 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1248  hypothetical protein  43.84 
 
 		 151 aa  103  7e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.236375 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01813  hypothetical protein  42.36 
 
 		 148 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0118637  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  48.57 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  45.97 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  40.43 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  41.01 
 
 		 143 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  41.73 
 
 		 144 aa  95.9  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  39.72 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  40.43 
 
 		 177 aa  95.5  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  39.29 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  38.73 
 
 		 146 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  38.3 
 
 		 146 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  38.3 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  38.3 
 
 		 146 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  36.43 
 
 		 146 aa  90.5  6e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  42.76 
 
 		 142 aa  90.5  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  89.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  42.14 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  42.55 
 
 		 178 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0151  hypothetical protein  42.47 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  36.88 
 
 		 178 aa  87.8  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  37.06 
 
 		 141 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  35.46 
 
 		 140 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  41.01 
 
 		 141 aa  87  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  37.59 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1325  hypothetical protein  42.06 
 
 		 125 aa  86.7  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0175884  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  37.59 
 
 		 178 aa  86.3  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  40.14 
 
 		 148 aa  86.7  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0172  hypothetical protein  41.78 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.445067  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  37.06 
 
 		 143 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>