160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3443 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  370  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  52 
 
 
184 aa  179  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03675  hypothetical protein  47.78 
 
 
182 aa  176  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0938  hypothetical protein  49.45 
 
 
183 aa  175  3e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  45.56 
 
 
186 aa  155  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1332  hypothetical protein  47.59 
 
 
181 aa  152  2e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3572  hypothetical protein  42.29 
 
 
175 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  43.17 
 
 
187 aa  142  2e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  45.81 
 
 
203 aa  142  4e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  43.18 
 
 
194 aa  140  9.999999999999999e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  43.75 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  43.75 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  42.22 
 
 
197 aa  135  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  42.39 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  39.56 
 
 
190 aa  124  7e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  39.01 
 
 
195 aa  124  7e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  39.56 
 
 
190 aa  123  2e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  43.45 
 
 
195 aa  122  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0329  hypothetical protein  43.89 
 
 
187 aa  115  3e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.541566  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  41.99 
 
 
188 aa  114  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  42.61 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  41.99 
 
 
188 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0398  hypothetical protein  38.51 
 
 
172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.85997  normal  0.904592 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  38.89 
 
 
168 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10021  hypothetical protein  43.33 
 
 
187 aa  107  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.764651  normal  0.386426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  39.86 
 
 
141 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  39.16 
 
 
141 aa  104  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  39.16 
 
 
141 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  38.17 
 
 
142 aa  101  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  38.46 
 
 
141 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  36.17 
 
 
139 aa  98.6  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  38.1 
 
 
143 aa  98.6  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  37.58 
 
 
171 aa  98.2  5e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  37.5 
 
 
141 aa  97.1  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0745  flagellin  38.78 
 
 
144 aa  97.4  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  38.19 
 
 
142 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  35.81 
 
 
149 aa  95.9  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  37.32 
 
 
140 aa  94.4  9e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  34.72 
 
 
142 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  36.91 
 
 
150 aa  93.6  1e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  38.78 
 
 
178 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  35.42 
 
 
148 aa  91.7  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  36.24 
 
 
150 aa  91.7  6e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  36.55 
 
 
145 aa  91.7  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  37.98 
 
 
140 aa  90.9  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  37.98 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  38.76 
 
 
140 aa  90.9  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  34.27 
 
 
141 aa  90.1  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  35.38 
 
 
143 aa  88.6  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  35.71 
 
 
142 aa  88.6  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  38.58 
 
 
140 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  38.46 
 
 
142 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  37.8 
 
 
140 aa  87.4  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  37.8 
 
 
137 aa  86.7  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0115  hypothetical protein  35.15 
 
 
170 aa  86.3  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  39.55 
 
 
178 aa  84.7  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  38.46 
 
 
140 aa  84.3  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  38.28 
 
 
139 aa  84.7  7e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  38.28 
 
 
139 aa  84.3  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  35.38 
 
 
142 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  32.88 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  35.38 
 
 
142 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1714  transmembrane protein  34.06 
 
 
148 aa  80.9  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.722222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  38.46 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  34.97 
 
 
143 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  31.72 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  34.4 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  38.1 
 
 
151 aa  79  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  35.37 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  36.55 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  33.33 
 
 
165 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  32.17 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  32.14 
 
 
142 aa  78.2  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0258  hypothetical protein  35.37 
 
 
141 aa  77.8  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0027  hypothetical protein  31.62 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  30.61 
 
 
146 aa  77  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  31.47 
 
 
146 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  31.97 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  32.17 
 
 
148 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  34.78 
 
 
136 aa  76.6  0.0000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  31.97 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  31.72 
 
 
144 aa  76.3  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  40.71 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  34.97 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  35.82 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  35.82 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  29.85 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  32.65 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  31.47 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  33.1 
 
 
140 aa  72.8  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  31.33 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  29.93 
 
 
146 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  29.93 
 
 
146 aa  72  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  33.57 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  32.87 
 
 
139 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  33.57 
 
 
178 aa  71.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  30.07 
 
 
141 aa  71.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  35.07 
 
 
142 aa  70.5  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  32.87 
 
 
140 aa  69.7  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>