156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3452 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  100 
 
 		 145 aa  295  1e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  70.42 
 
 		 165 aa  211  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  70.42 
 
 		 165 aa  209  1e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  69.72 
 
 		 165 aa  208  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  65.71 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  58.16 
 
 		 151 aa  175  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  54.61 
 
 		 149 aa  147  3e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  51.03 
 
 		 141 aa  141  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  51.03 
 
 		 141 aa  140  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  51.03 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  50.7 
 
 		 149 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  50.34 
 
 		 141 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  51.05 
 
 		 148 aa  133  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  49.3 
 
 		 143 aa  133  9e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  49.3 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  49.3 
 
 		 146 aa  130  6e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  49.65 
 
 		 146 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  45.45 
 
 		 177 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  48.59 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  47.22 
 
 		 178 aa  128  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  43.45 
 
 		 146 aa  126  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  43.06 
 
 		 178 aa  125  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  45.14 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  46.53 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  46.85 
 
 		 141 aa  124  5e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  47.59 
 
 		 148 aa  123  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  43.06 
 
 		 146 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  47.55 
 
 		 141 aa  122  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  42.36 
 
 		 146 aa  122  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  42.36 
 
 		 178 aa  120  4e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  42.36 
 
 		 178 aa  120  4e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  46.53 
 
 		 140 aa  119  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  43.06 
 
 		 142 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  41.96 
 
 		 142 aa  117  3.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  41.55 
 
 		 143 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  44.44 
 
 		 178 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  47.59 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  43.36 
 
 		 139 aa  114  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  41.26 
 
 		 140 aa  110  9e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  42.36 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  45.45 
 
 		 195 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  43.06 
 
 		 180 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  44.44 
 
 		 142 aa  107  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  45.14 
 
 		 142 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  42.86 
 
 		 151 aa  106  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  40.41 
 
 		 141 aa  105  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  43.66 
 
 		 179 aa  104  3e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  40.28 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  35.17 
 
 		 140 aa  103  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  38.89 
 
 		 168 aa  103  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  39.58 
 
 		 144 aa  103  7e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0384  hypothetical protein  42.96 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0211901 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  43.15 
 
 		 143 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  35.92 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  100  8e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  38.36 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  38.62 
 
 		 150 aa  99.4  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  38.46 
 
 		 139 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  43.36 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  38.57 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  40.69 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  36.81 
 
 		 140 aa  96.3  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  38.03 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  41.55 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  42.36 
 
 		 140 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  40.85 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  41.67 
 
 		 140 aa  93.6  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  38.64 
 
 		 203 aa  92.8  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  43.45 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0115  hypothetical protein  36.55 
 
 		 170 aa  92  3e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3443  hypothetical protein  36.55 
 
 		 182 aa  91.7  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  36.69 
 
 		 136 aa  90.1  9e-18  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  35.62 
 
 		 144 aa  89.4  1e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  35.25 
 
 		 194 aa  89.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  33.8 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  35.17 
 
 		 187 aa  89  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  37.86 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0112  hypothetical membrane spanning protein  42.76 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  40.41 
 
 		 142 aa  87.8  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2084  hypothetical protein  42.36 
 
 		 139 aa  88.2  4e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3754  hypothetical protein  40 
 
 		 184 aa  87.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.182605  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  34.85 
 
 		 187 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  34.85 
 
 		 187 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14931  hypothetical protein  35.82 
 
 		 195 aa  86.7  9e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.398676 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1360  hypothetical protein  36.3 
 
 		 190 aa  86.7  1e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.905628  normal  0.269877 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  35.66 
 
 		 140 aa  86.3  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1118  hypothetical protein  34.33 
 
 		 190 aa  85.5  2e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.741307  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  37.78 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09781  hypothetical protein  38.28 
 
 		 188 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.711198  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  34.48 
 
 		 171 aa  84.3  4e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0919  hypothetical protein  38.28 
 
 		 188 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.113823  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09801  hypothetical protein  38.28 
 
 		 188 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  34.35 
 
 		 197 aa  84  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  35.92 
 
 		 142 aa  84  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0027  hypothetical protein  34.48 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  35.17 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1332  hypothetical protein  34 
 
 		 181 aa  82.4  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08831  hypothetical protein  38.24 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.152227  hitchhiker  0.0000304653 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5018  hypothetical protein  38.3 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0850066  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>