161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3207 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  74.01 
 
 		 178 aa  275  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  75.14 
 
 		 178 aa  252  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  59.76 
 
 		 177 aa  208  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  52.87 
 
 		 178 aa  204  4e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  52.87 
 
 		 178 aa  204  6e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  50.85 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  59.09 
 
 		 179 aa  193  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  56.76 
 
 		 146 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  60.99 
 
 		 144 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  57.45 
 
 		 146 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  56.74 
 
 		 146 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  57.55 
 
 		 140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  58.04 
 
 		 146 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  58.04 
 
 		 146 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  57.34 
 
 		 146 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  55.8 
 
 		 143 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  55.8 
 
 		 139 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  52.82 
 
 		 143 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  57.14 
 
 		 141 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  57.86 
 
 		 141 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  55.8 
 
 		 140 aa  160  9e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  52.48 
 
 		 148 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  52.86 
 
 		 141 aa  155  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  55.32 
 
 		 143 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  47.89 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  49.3 
 
 		 149 aa  135  5e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  46.15 
 
 		 151 aa  128  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  45.77 
 
 		 165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  45.07 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  43.06 
 
 		 145 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  45.07 
 
 		 165 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  47.55 
 
 		 141 aa  121  7e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  47.55 
 
 		 141 aa  120  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  47.55 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  47.55 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  42.66 
 
 		 140 aa  117  9e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  43.38 
 
 		 136 aa  116  1.9999999999999998e-25  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  36.55 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  36.55 
 
 		 150 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  36.55 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  44.6 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  43.97 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  43.97 
 
 		 142 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  42.86 
 
 		 142 aa  111  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  45.39 
 
 		 142 aa  110  1.0000000000000001e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  41.84 
 
 		 144 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  44.29 
 
 		 148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  36.81 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  40.56 
 
 		 141 aa  108  5e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  42.55 
 
 		 142 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  46.38 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  44.29 
 
 		 140 aa  104  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  48.94 
 
 		 142 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  44.93 
 
 		 137 aa  104  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  39.72 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  40 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  41.43 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  42.07 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  45.07 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  102  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  40 
 
 		 142 aa  103  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  43.26 
 
 		 142 aa  102  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  43.06 
 
 		 144 aa  101  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  37.76 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  36.96 
 
 		 168 aa  98.6  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  46.81 
 
 		 142 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  40.85 
 
 		 140 aa  97.1  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  41.73 
 
 		 141 aa  96.7  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  37.23 
 
 		 149 aa  94.7  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  35.46 
 
 		 148 aa  94.7  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  43.57 
 
 		 140 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  43.57 
 
 		 140 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  36.73 
 
 		 187 aa  92.8  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  37.68 
 
 		 141 aa  92  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  36.36 
 
 		 138 aa  91.3  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  37.06 
 
 		 138 aa  91.3  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  37.76 
 
 		 171 aa  91.3  8e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  41.43 
 
 		 140 aa  90.5  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5018  hypothetical protein  39.29 
 
 		 154 aa  90.9  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0850066  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  41.43 
 
 		 140 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4233  hypothetical protein  39.86 
 
 		 146 aa  89.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.225935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  89  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  35 
 
 		 140 aa  88.6  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  87.8  7e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  36.43 
 
 		 140 aa  87.8  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  34.29 
 
 		 140 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  37.12 
 
 		 203 aa  85.1  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0366  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1225  hypothetical protein  35.71 
 
 		 147 aa  85.1  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0027  hypothetical protein  35.21 
 
 		 147 aa  85.1  5e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2449  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.906177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3446  hypothetical protein  35.71 
 
 		 140 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3411  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3446  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  84.7  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.600198  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  35.71 
 
 		 138 aa  84.7  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0381  hypothetical protein  37.32 
 
 		 142 aa  84.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905108  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>