162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_4392 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_4392  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  361  3e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4259  hypothetical protein  59.66 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.781218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3933  hypothetical protein  60.23 
 
 		 178 aa  201  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_004310  BR2065  hypothetical protein  54.07 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.101889  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1985  hypothetical protein  54.07 
 
 		 178 aa  197  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0855  hypothetical protein  51.98 
 
 		 178 aa  194  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.275391  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3475  hypothetical protein  53.22 
 
 		 177 aa  185  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3207  hypothetical protein  59.09 
 
 		 180 aa  181  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3568  hypothetical protein  57.75 
 
 		 143 aa  165  2.9999999999999998e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0558336  normal  0.555029 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0394  hypothetical protein  56.83 
 
 		 146 aa  164  4e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.776643  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0299  hypothetical protein  54.68 
 
 		 146 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0427  hypothetical protein  56.12 
 
 		 146 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1496  hypothetical protein  53.85 
 
 		 146 aa  155  3e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0864427 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1774  hypothetical protein  54.29 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.151606  normal  0.251617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1040  hypothetical protein  53.96 
 
 		 141 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1495  hypothetical protein  54.29 
 
 		 146 aa  152  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.44802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0293  hypothetical protein  52.17 
 
 		 143 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1825  hypothetical protein  53.24 
 
 		 144 aa  150  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0349545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1270  hypothetical protein  54.68 
 
 		 141 aa  150  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0111  hypothetical protein  52.9 
 
 		 139 aa  150  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0162  hypothetical protein  51.08 
 
 		 140 aa  150  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0779497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0101  hypothetical protein  51.45 
 
 		 140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.761518  normal  0.0623119 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2533  hypothetical protein  50.72 
 
 		 141 aa  143  2e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4297  hypothetical protein  49.64 
 
 		 143 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.818431  normal  0.0309723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0464  hypothetical protein  44.29 
 
 		 141 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424113 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0431  hypothetical protein  43.57 
 
 		 141 aa  124  6e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.383973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0461  hypothetical protein  43.57 
 
 		 141 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.335384  normal  0.121945 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4772  hypothetical protein  43.57 
 
 		 141 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338274  normal  0.685574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1259  hypothetical protein  42.14 
 
 		 148 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3452  UPF0093 membrane protein  44.22 
 
 		 145 aa  117  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3618  hypothetical protein  41.96 
 
 		 148 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3934  hypothetical protein  43.97 
 
 		 142 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46050  hypothetical protein  43.97 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5103  hypothetical protein  47.18 
 
 		 142 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.605175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2669  hypothetical protein  42.14 
 
 		 165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00312015  normal  0.333956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0689  hypothetical protein  40.43 
 
 		 140 aa  109  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.885793  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2472  hypothetical protein  42.86 
 
 		 149 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1232  putative integral membrane protein  40.71 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2893  hypothetical protein  40.71 
 
 		 165 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.337195  normal  0.917472 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4570  hypothetical protein  48.23 
 
 		 142 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0119  hypothetical protein  46.76 
 
 		 141 aa  104  6e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0603  hypothetical protein  47.52 
 
 		 142 aa  104  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2971  hypothetical protein  38.89 
 
 		 151 aa  104  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2862  hypothetical protein  41.43 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.333976 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0001  hypothetical protein  43.36 
 
 		 148 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000267059  normal  0.819337 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0349  hypothetical protein  39.71 
 
 		 136 aa  100  8e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1565  conserved hypothetical integral membrane protein (UPF0093 domain protein)  36.88 
 
 		 149 aa  100  8e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0228  hypothetical protein  41.01 
 
 		 139 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0391  hypothetical protein  40.71 
 
 		 140 aa  99.8  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2151  hypothetical protein  41.43 
 
 		 144 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1925  hypothetical protein  43.17 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.975462  normal  0.614491 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0881  hypothetical protein  39.16 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.569107  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2834  hypothetical protein  41.13 
 
 		 150 aa  99.8  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.16936 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1862  hypothetical protein  40.71 
 
 		 144 aa  99.4  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.521367  normal  0.897697 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08470  hypothetical protein  43.57 
 
 		 140 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178452 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0411  hypothetical protein  33.79 
 
 		 150 aa  98.6  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1594  hypothetical protein  33.79 
 
 		 150 aa  98.6  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0385  hypothetical protein  33.79 
 
 		 150 aa  97.8  7e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0802  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.994643  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0702  hypothetical protein  42.75 
 
 		 137 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1490  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  95.9  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1493  hypothetical protein  42.86 
 
 		 140 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0474  hypothetical protein  42.75 
 
 		 137 aa  94.7  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0431  hypothetical protein  40.71 
 
 		 140 aa  94  9e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0111877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0646  hypothetical protein  44.14 
 
 		 142 aa  94.4  9e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.191935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01598  hypothetical protein  40.43 
 
 		 142 aa  93.6  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2413  hypothetical protein  35.71 
 
 		 168 aa  92  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0417  hypothetical protein  41.73 
 
 		 142 aa  91.3  7e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.260931  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2765  hypothetical protein  36.11 
 
 		 194 aa  90.1  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2844  hypothetical protein  37.67 
 
 		 149 aa  90.9  1e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0591759 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0547  hypothetical protein  38.73 
 
 		 142 aa  90.5  1e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0115  hypothetical protein  35.86 
 
 		 170 aa  90.1  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0107  hypothetical protein  38.93 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0104  hypothetical protein  38.93 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.805138  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2188  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  89.4  3e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.110489  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4625  hypothetical protein  32.64 
 
 		 148 aa  89  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3376  hypothetical protein  36.62 
 
 		 138 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0317356  hitchhiker  0.000000000730541 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0478  hypothetical protein  36.81 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.594708 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0097  hypothetical protein  37.96 
 
 		 144 aa  86.7  2e-16  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0831  hypothetical protein  35.51 
 
 		 141 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0580  hypothetical protein  35.92 
 
 		 138 aa  86.7  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3301  hypothetical protein  42.96 
 
 		 143 aa  86.3  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0835749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0175  hypothetical protein  37.76 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0658  hypothetical protein  37.76 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.431582  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0625  hypothetical protein  37.76 
 
 		 140 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1468  hypothetical protein  34.72 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200067  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0148  hypothetical protein  36.5 
 
 		 144 aa  85.5  3e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2728  hypothetical protein  37.76 
 
 		 140 aa  85.5  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1714  transmembrane protein  34.48 
 
 		 148 aa  85.5  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.722222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0628  hypothetical protein  34.27 
 
 		 171 aa  85.1  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000401356  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2584  hypothetical protein  35.66 
 
 		 140 aa  85.1  5e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.681885  hitchhiker  0.00000000000477128 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4270  hypothetical protein  38.17 
 
 		 197 aa  84.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0579  hypothetical protein  36.36 
 
 		 140 aa  84.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.599528 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3744  hypothetical protein  35.21 
 
 		 140 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.440818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1258  hypothetical protein  37.32 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0849  hypothetical protein  35.11 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0214356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0553  hypothetical protein  35.66 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.65595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1332  hypothetical protein  35.81 
 
 		 181 aa  83.2  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3722  hypothetical protein  38.97 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2636  hypothetical protein  37.33 
 
 		 138 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>