15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0620 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007204  Psyc_0620  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  283  4e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0764  hypothetical protein  59.59 
 
 		 146 aa  178  2.9999999999999997e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.503732  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2513  hypothetical protein  56.25 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3166  hypothetical protein  55.56 
 
 		 148 aa  141  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03856  hypothetical protein  46.9 
 
 		 147 aa  132  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.857117  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4061  hypothetical protein  45.07 
 
 		 148 aa  130  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1023  hypothetical protein  43.7 
 
 		 152 aa  118  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.271245  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61000  hypothetical protein  44.76 
 
 		 144 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5250  hypothetical protein  44.06 
 
 		 144 aa  103  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2694  hypothetical protein  44.52 
 
 		 166 aa  101  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13541  hypothetical protein  37.5 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2155  copper resistance D  34.21 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.976167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3564  hypothetical protein  30.39 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  29.25 
 
 		 165 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  26.96 
 
 		 310 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>