71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1956 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  100 
 
 
315 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  89.21 
 
 
314 aa  534  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  89.52 
 
 
314 aa  536  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  90.16 
 
 
315 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  67.83 
 
 
313 aa  392  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  66.88 
 
 
313 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  66.88 
 
 
313 aa  370  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  67.2 
 
 
313 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  67.1 
 
 
306 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  67.83 
 
 
313 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  67.83 
 
 
313 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  62.22 
 
 
313 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  56.19 
 
 
314 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  56.19 
 
 
314 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  33.33 
 
 
364 aa  97.4  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  38.26 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  38.26 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  38.26 
 
 
310 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  36.48 
 
 
310 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  37.3 
 
 
310 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  36.98 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  36.98 
 
 
310 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  38.02 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  38.02 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  38.02 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  38.02 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  38.02 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  38.02 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  38.02 
 
 
308 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  34.82 
 
 
309 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  35.2 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  34.62 
 
 
311 aa  62  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  31.91 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  31.91 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 
578 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  32.28 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  33.33 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  25.78 
 
 
316 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  31.51 
 
 
310 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  26.97 
 
 
291 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  35.83 
 
 
322 aa  52  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  28.5 
 
 
310 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  32.89 
 
 
309 aa  50.8  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  22.6 
 
 
439 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  21.78 
 
 
544 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  21.78 
 
 
544 aa  50.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  26.64 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  26.64 
 
 
291 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  20.98 
 
 
544 aa  49.7  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.73 
 
 
565 aa  49.3  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  21.95 
 
 
549 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  31.73 
 
 
564 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  26.64 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  32.57 
 
 
299 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  28.85 
 
 
290 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  32.49 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  27.95 
 
 
718 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  20 
 
 
547 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  29.52 
 
 
718 aa  47  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  21.96 
 
 
547 aa  46.2  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  24.14 
 
 
547 aa  46.2  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31.61 
 
 
560 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  31.71 
 
 
571 aa  44.3  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  31.79 
 
 
308 aa  45.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  29.81 
 
 
400 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  33.95 
 
 
588 aa  43.9  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  26.64 
 
 
291 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  24.34 
 
 
927 aa  43.5  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.21 
 
 
343 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  31.62 
 
 
309 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  20 
 
 
549 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>