63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6848 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  659    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  50.87 
 
 		 339 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  42.14 
 
 		 343 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  31.71 
 
 		 651 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  25.47 
 
 		 718 aa  79.3  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  29.44 
 
 		 678 aa  77  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  28.31 
 
 		 718 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  26.92 
 
 		 697 aa  71.2  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  34.19 
 
 		 664 aa  70.1  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  30.5 
 
 		 692 aa  69.7  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  33.81 
 
 		 739 aa  66.6  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  33.33 
 
 		 708 aa  66.2  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.02 
 
 		 731 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  34.66 
 
 		 687 aa  63.9  0.000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.44 
 
 		 675 aa  63.5  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  38.85 
 
 		 681 aa  62.4  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  29.09 
 
 		 687 aa  61.6  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  29.14 
 
 		 671 aa  59.7  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  30.93 
 
 		 708 aa  56.2  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  27.61 
 
 		 642 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  26.84 
 
 		 691 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  32.76 
 
 		 322 aa  55.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  32.56 
 
 		 310 aa  52.8  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  35.96 
 
 		 632 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  29.22 
 
 		 686 aa  50.1  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  30.66 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  30.66 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5680  copper resistance D domain-containing protein  27.27 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  27.83 
 
 		 651 aa  48.5  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  31.9 
 
 		 290 aa  47.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  30.86 
 
 		 631 aa  46.6  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  32.12 
 
 		 309 aa  46.6  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  29.23 
 
 		 722 aa  46.2  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 		 869 aa  46.2  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  27.54 
 
 		 736 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  29.78 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  27.07 
 
 		 665 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  27.07 
 
 		 665 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  28.23 
 
 		 646 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  31.71 
 
 		 711 aa  45.8  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  27.07 
 
 		 665 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  28.25 
 
 		 679 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  43.59 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  29.78 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  31.43 
 
 		 309 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  30 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  28.66 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  33.62 
 
 		 309 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  30.97 
 
 		 719 aa  44.3  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  28.18 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  27.83 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  27.69 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  29.2 
 
 		 287 aa  43.9  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  31.21 
 
 		 672 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  25.43 
 
 		 676 aa  43.9  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  29.94 
 
 		 551 aa  43.9  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  28.46 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  28.46 
 
 		 291 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  29.78 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  29.85 
 
 		 313 aa  43.1  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  29.46 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  28.76 
 
 		 671 aa  42.7  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  28.46 
 
 		 291 aa  42.7  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>