40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5680 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5680  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 307 aa  568  1e-161  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1126  copper resistance D domain-containing protein  69.93 
 
 		 297 aa  289  3e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  56.06 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  56.06 
 
 		 309 aa  224  1e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5432  copper resistance D domain-containing protein  55.02 
 
 		 309 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165296  normal  0.69712 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1161  copper resistance D domain protein  42.31 
 
 		 310 aa  96.3  6e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  32.86 
 
 		 339 aa  73.6  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  33.57 
 
 		 343 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  26.33 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  33.87 
 
 		 559 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  36.29 
 
 		 681 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  28.95 
 
 		 687 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  28 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  34.82 
 
 		 692 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  34.44 
 
 		 664 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 		 588 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  34.02 
 
 		 400 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  39.26 
 
 		 576 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  28 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  35.09 
 
 		 551 aa  47  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3511  copper resistance D domain-containing protein  41.56 
 
 		 270 aa  46.6  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  31.96 
 
 		 559 aa  46.6  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  30.68 
 
 		 739 aa  45.8  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  23.72 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  34.96 
 
 		 513 aa  45.8  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  23.72 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  23.72 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  23.72 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  23.72 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  30.77 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  33.64 
 
 		 613 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  23.72 
 
 		 290 aa  44.3  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  31.91 
 
 		 165 aa  43.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  29.6 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  23.32 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  31.25 
 
 		 291 aa  43.1  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  23.72 
 
 		 290 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  38.27 
 
 		 528 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  31.25 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  31.25 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>