139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3617 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  100 
 
 		 665 aa  1284    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  58.31 
 
 		 641 aa  656    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 665 aa  1284    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  59.84 
 
 		 642 aa  683    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  76.98 
 
 		 672 aa  848    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  99.85 
 
 		 665 aa  1283    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  76.21 
 
 		 676 aa  850    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  59.42 
 
 		 646 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  58.31 
 
 		 641 aa  656    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  57.92 
 
 		 637 aa  652    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  59.75 
 
 		 675 aa  715    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  54.12 
 
 		 651 aa  673    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  60.07 
 
 		 687 aa  677    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  48.39 
 
 		 686 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  44.55 
 
 		 678 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  44.71 
 
 		 681 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  44.37 
 
 		 664 aa  426  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  40.35 
 
 		 718 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  45.66 
 
 		 632 aa  412  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  42.79 
 
 		 692 aa  412  1e-113  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  43.9 
 
 		 651 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  41.09 
 
 		 718 aa  412  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  43.45 
 
 		 679 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.35 
 
 		 731 aa  404  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  41.59 
 
 		 691 aa  391  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  40.58 
 
 		 708 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  45.36 
 
 		 722 aa  361  3e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  37.5 
 
 		 697 aa  358  1.9999999999999998e-97  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  54.14 
 
 		 661 aa  357  2.9999999999999997e-97  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  45.67 
 
 		 671 aa  357  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  39.55 
 
 		 631 aa  353  4e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  40.51 
 
 		 739 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  37.04 
 
 		 708 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  38.19 
 
 		 736 aa  337  2.9999999999999997e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  36.98 
 
 		 752 aa  336  7.999999999999999e-91  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  39.85 
 
 		 711 aa  311  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  38.93 
 
 		 719 aa  309  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  38.13 
 
 		 671 aa  305  2.0000000000000002e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.9 
 
 		 683 aa  300  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  34.43 
 
 		 687 aa  291  2e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.28 
 
 		 613 aa  271  2e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  33.74 
 
 		 654 aa  261  3e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  50 
 
 		 319 aa  238  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  44.55 
 
 		 319 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  42.81 
 
 		 310 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  41.9 
 
 		 328 aa  208  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  38.25 
 
 		 322 aa  189  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  39.78 
 
 		 651 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  38.75 
 
 		 322 aa  184  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  38.68 
 
 		 331 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  38.19 
 
 		 331 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  38.19 
 
 		 331 aa  178  2e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  38.33 
 
 		 326 aa  177  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  38.03 
 
 		 308 aa  176  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  38.41 
 
 		 322 aa  174  5.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.09 
 
 		 307 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  29.17 
 
 		 653 aa  133  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  33.22 
 
 		 387 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  34.78 
 
 		 273 aa  109  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  28.44 
 
 		 394 aa  107  5e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  28.02 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.86 
 
 		 326 aa  95.5  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  33.64 
 
 		 604 aa  95.5  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  26.45 
 
 		 274 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  30.81 
 
 		 254 aa  93.6  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  25.79 
 
 		 327 aa  93.6  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  25.94 
 
 		 277 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  26.22 
 
 		 277 aa  89.4  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  25.94 
 
 		 277 aa  89.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  25.94 
 
 		 277 aa  89.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  26.22 
 
 		 265 aa  88.6  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.38 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  37.36 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  30.42 
 
 		 300 aa  73.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.38 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0170  hypothetical protein  30.07 
 
 		 332 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  26.5 
 
 		 264 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  27.24 
 
 		 322 aa  67  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  26.43 
 
 		 343 aa  65.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  29.31 
 
 		 315 aa  66.6  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  25.44 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  26.06 
 
 		 294 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3278  membrane protein  26.61 
 
 		 280 aa  63.9  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.51 
 
 		 291 aa  63.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  24.57 
 
 		 270 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.26 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  27.53 
 
 		 290 aa  62  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  25.69 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  26.67 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1859  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  24.28 
 
 		 300 aa  60.1  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  24.83 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0988  cytochrome c oxidase assembly factor CtaG  23.51 
 
 		 300 aa  58.2  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  25.64 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  27.71 
 
 		 290 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>