111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  57.04 
 
 		 687 aa  694    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  100 
 
 		 708 aa  1386    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  51.68 
 
 		 722 aa  592  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  55.41 
 
 		 683 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  44.11 
 
 		 718 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  51.23 
 
 		 711 aa  548  1e-154  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  44.35 
 
 		 718 aa  535  1e-150  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  41.46 
 
 		 752 aa  478  1e-133  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  47.77 
 
 		 671 aa  456  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  43.55 
 
 		 697 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  41.43 
 
 		 708 aa  419  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  40.77 
 
 		 631 aa  414  1e-114  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  40.99 
 
 		 739 aa  394  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  38.93 
 
 		 651 aa  387  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  40.8 
 
 		 678 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  39.59 
 
 		 687 aa  379  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  38.07 
 
 		 664 aa  370  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.65 
 
 		 731 aa  353  4e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.61 
 
 		 675 aa  353  8e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  38.75 
 
 		 681 aa  350  4e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  37.94 
 
 		 665 aa  347  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  37.94 
 
 		 665 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  37.94 
 
 		 665 aa  347  4e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  38.33 
 
 		 692 aa  337  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  39.13 
 
 		 671 aa  333  5e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  40.35 
 
 		 686 aa  323  6e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  35.66 
 
 		 691 aa  322  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  41.54 
 
 		 719 aa  315  9.999999999999999e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  37.29 
 
 		 676 aa  315  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  37.35 
 
 		 672 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  39.62 
 
 		 736 aa  295  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  39.92 
 
 		 679 aa  290  9e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  39.72 
 
 		 651 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  43.91 
 
 		 661 aa  261  4e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  36.26 
 
 		 653 aa  257  6e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  34.68 
 
 		 632 aa  254  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  31.85 
 
 		 646 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  33.5 
 
 		 641 aa  233  1e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  33.5 
 
 		 641 aa  233  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  32.01 
 
 		 642 aa  231  3e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  33.44 
 
 		 637 aa  227  7e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  41.01 
 
 		 319 aa  206  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.25 
 
 		 654 aa  182  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  34.63 
 
 		 310 aa  180  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  40.78 
 
 		 319 aa  172  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  40.29 
 
 		 322 aa  165  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  38.17 
 
 		 328 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  38.43 
 
 		 322 aa  161  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  35.34 
 
 		 651 aa  159  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  35.25 
 
 		 322 aa  151  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  29.96 
 
 		 613 aa  124  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  32.12 
 
 		 331 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  31.75 
 
 		 331 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  31.14 
 
 		 326 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  31.75 
 
 		 331 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  31.39 
 
 		 308 aa  118  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  30.66 
 
 		 604 aa  105  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.61 
 
 		 307 aa  103  8e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  26.76 
 
 		 387 aa  98.6  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  31.27 
 
 		 354 aa  94  9e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  35.56 
 
 		 254 aa  93.6  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  37.78 
 
 		 273 aa  93.6  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  28.4 
 
 		 265 aa  89  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  30.65 
 
 		 326 aa  89  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  28.16 
 
 		 277 aa  88.2  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  26.81 
 
 		 277 aa  87  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  27.08 
 
 		 277 aa  87  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  26.59 
 
 		 274 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  26.81 
 
 		 277 aa  87  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  28.77 
 
 		 394 aa  85.9  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  25.9 
 
 		 327 aa  86.3  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  33.15 
 
 		 547 aa  72.8  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  30.39 
 
 		 544 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  30.34 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  34.75 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  30.9 
 
 		 549 aa  68.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  30.34 
 
 		 547 aa  67.8  0.0000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  32.86 
 
 		 544 aa  67  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  32.86 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  28.72 
 
 		 343 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  32.86 
 
 		 544 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  32.86 
 
 		 544 aa  66.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  31.98 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  30.65 
 
 		 315 aa  60.5  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  34.3 
 
 		 869 aa  59.7  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  32 
 
 		 339 aa  57.8  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.06 
 
 		 246 aa  55.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3086  hypothetical protein  30.95 
 
 		 235 aa  52.8  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0589331  hitchhiker  0.00886483 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 613 aa  52.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01478  membrane protein-like protein  29.06 
 
 		 267 aa  53.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  27.85 
 
 		 270 aa  50.8  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 564 aa  50.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  36.13 
 
 		 565 aa  50.8  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  26.72 
 
 		 264 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  32.8 
 
 		 319 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3552  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  35.03 
 
 		 291 aa  50.1  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223965  normal  0.817267 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  32.47 
 
 		 343 aa  49.7  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  27.63 
 
 		 265 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4795  hypothetical protein  27.35 
 
 		 322 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  32.03 
 
 		 571 aa  48.1  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>