51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2125 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 292 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  49.31 
 
 		 291 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  42.66 
 
 		 290 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  41.26 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  41.1 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  41.1 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  41.61 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  41.05 
 
 		 291 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  38.81 
 
 		 290 aa  168  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  43.21 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  38.46 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  38.46 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  38.46 
 
 		 290 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  38.46 
 
 		 290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  38.11 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  38.11 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  37.41 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  37.41 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  35.15 
 
 		 294 aa  141  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  35.15 
 
 		 294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  34.81 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  31.85 
 
 		 292 aa  122  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  32.67 
 
 		 285 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  35.68 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  35.81 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  40.43 
 
 		 283 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  28.47 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  30.83 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  25.45 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  32.93 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  30.41 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  33.16 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  27.76 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  27.76 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  30.08 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  33.8 
 
 		 288 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  32.81 
 
 		 322 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  32.61 
 
 		 308 aa  55.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  29.31 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  29.32 
 
 		 313 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  24.92 
 
 		 316 aa  51.6  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  37.86 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  29.17 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  23.87 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  29.05 
 
 		 310 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  30.59 
 
 		 294 aa  45.8  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  28.03 
 
 		 708 aa  44.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  31.58 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  27.53 
 
 		 687 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  30.84 
 
 		 343 aa  42.7  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  28.28 
 
 		 718 aa  42.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>