52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1602 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1602  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 383 aa  738    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.265845 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0922  copper resistance D domain protein  43.58 
 
 		 295 aa  129  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.140302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  33.93 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  39.01 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.22 
 
 		 613 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  33.49 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  33.19 
 
 		 292 aa  58.5  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  26.59 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  29.67 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  26.16 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  41.46 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  26.09 
 
 		 571 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  38.79 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  35.65 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  31.58 
 
 		 651 aa  54.3  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  37.6 
 
 		 288 aa  54.3  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  31.33 
 
 		 692 aa  54.7  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  35.37 
 
 		 290 aa  53.5  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  35.71 
 
 		 294 aa  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  34 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  28.91 
 
 		 291 aa  51.2  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  26.24 
 
 		 578 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  34.78 
 
 		 314 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.96 
 
 		 565 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  31.58 
 
 		 679 aa  49.7  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  25.17 
 
 		 547 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  35.71 
 
 		 293 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  31.29 
 
 		 588 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  35.33 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  34.44 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  35.33 
 
 		 291 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  28.57 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  32.85 
 
 		 576 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  28.4 
 
 		 718 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  34.53 
 
 		 564 aa  47.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  32.09 
 
 		 322 aa  47.4  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  24.91 
 
 		 560 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  32.57 
 
 		 310 aa  46.6  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  28.97 
 
 		 686 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  24.04 
 
 		 549 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  29.63 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  40.22 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.04 
 
 		 544 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  30.49 
 
 		 687 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  23.78 
 
 		 547 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  29.53 
 
 		 632 aa  44.3  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  31.21 
 
 		 671 aa  44.3  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  36.99 
 
 		 283 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  23.08 
 
 		 549 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  28.7 
 
 		 718 aa  43.1  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  23.69 
 
 		 547 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  35.46 
 
 		 290 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>