80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4448 on replicon NC_008537
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  50.16 
 
 
326 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  48.75 
 
 
331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  50.33 
 
 
308 aa  282  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  48.75 
 
 
331 aa  282  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  49.06 
 
 
331 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  50.53 
 
 
307 aa  271  1e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  38.51 
 
 
319 aa  212  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  39.87 
 
 
319 aa  212  9e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  39.16 
 
 
665 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  39.16 
 
 
665 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  39.16 
 
 
665 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  38.57 
 
 
651 aa  169  7e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  35.4 
 
 
681 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  36.39 
 
 
661 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  34.95 
 
 
686 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  38.94 
 
 
736 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  34.98 
 
 
687 aa  157  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  39.37 
 
 
672 aa  155  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  36.91 
 
 
719 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  33.45 
 
 
718 aa  152  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  35.96 
 
 
692 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  36.11 
 
 
708 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  33.68 
 
 
718 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  36.94 
 
 
679 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  35.07 
 
 
678 aa  149  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  36.14 
 
 
675 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.59 
 
 
731 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  35.23 
 
 
722 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  34.11 
 
 
691 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  39.37 
 
 
676 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  36.45 
 
 
651 aa  142  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  34.97 
 
 
697 aa  139  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  36.62 
 
 
671 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  35.37 
 
 
711 aa  137  3.0000000000000003e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  36.17 
 
 
632 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  32.17 
 
 
752 aa  134  3e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  34.39 
 
 
708 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  32.64 
 
 
631 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  32.89 
 
 
664 aa  129  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.71 
 
 
654 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  32.65 
 
 
671 aa  122  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  34.81 
 
 
739 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  30.57 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.01 
 
 
683 aa  119  6e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  30.62 
 
 
687 aa  116  5e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  31.73 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  31.41 
 
 
328 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  32.82 
 
 
322 aa  105  9e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  28.87 
 
 
613 aa  90.1  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  27.05 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  26.4 
 
 
394 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  29.88 
 
 
646 aa  77.4  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  29.28 
 
 
354 aa  77  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  30.95 
 
 
642 aa  75.9  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  29.39 
 
 
637 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  29.15 
 
 
641 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  29.15 
 
 
641 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  24.54 
 
 
327 aa  71.6  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  29.03 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  29.58 
 
 
273 aa  65.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  30.43 
 
 
254 aa  59.3  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  25 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  22.81 
 
 
309 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  24.29 
 
 
264 aa  57.4  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  31.23 
 
 
651 aa  56.2  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  22.31 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  22.31 
 
 
277 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  24.47 
 
 
265 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0701  hypothetical protein  27.98 
 
 
318 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  21.92 
 
 
277 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  22.31 
 
 
277 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  22.99 
 
 
274 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  23.51 
 
 
265 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  23.19 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2351  hypothetical protein  26.47 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.50053  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2987  hypothetical protein  27.02 
 
 
298 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101551  normal  0.0487928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0108  membrane protein-like protein  23.38 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  23.05 
 
 
294 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0093  hypothetical protein  26.27 
 
 
316 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>