136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0197 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 244 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  45 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  35.41 
 
 		 206 aa  101  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.39 
 
 		 197 aa  96.7  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  44.72 
 
 		 208 aa  95.9  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 		 184 aa  93.6  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  32.29 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  45.38 
 
 		 180 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  39.85 
 
 		 210 aa  88.6  9e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  33.67 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  39.15 
 
 		 284 aa  87.4  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  46.02 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  46.49 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  43.43 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  42.15 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  35.23 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  42.15 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  42.15 
 
 		 174 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  41.94 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  42.64 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  43.18 
 
 		 196 aa  79  0.00000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  41.35 
 
 		 172 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  44.74 
 
 		 223 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  41.23 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  41.13 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  44.74 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  44.33 
 
 		 434 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.76 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  44.76 
 
 		 203 aa  74.3  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  40.94 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  42.42 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40.54 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  46.07 
 
 		 184 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  45.61 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  35.07 
 
 		 869 aa  72  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  37.4 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 564 aa  71.2  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  43.36 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.79 
 
 		 565 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  40.38 
 
 		 576 aa  68.9  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  41.32 
 
 		 513 aa  68.9  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  40.19 
 
 		 593 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  43.81 
 
 		 424 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  41.67 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  36 
 
 		 173 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  40 
 
 		 519 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 		 560 aa  65.5  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  36.36 
 
 		 539 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  46.81 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  38.06 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  36.75 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  38.1 
 
 		 588 aa  61.6  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  37.82 
 
 		 605 aa  60.1  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  37.96 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  34.4 
 
 		 578 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  37.6 
 
 		 559 aa  58.9  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  34.35 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  38.32 
 
 		 607 aa  58.9  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  34.35 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  34.35 
 
 		 140 aa  58.5  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  38.02 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  41.12 
 
 		 551 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  38.02 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  38.02 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  28.72 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  36 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  43.3 
 
 		 512 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 127 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  24.6 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  24.6 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  36.3 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 120 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 		 118 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 590 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 126 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  21.02 
 
 		 547 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 613 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  21.43 
 
 		 544 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  34.15 
 
 		 124 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  22.31 
 
 		 549 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  32.11 
 
 		 120 aa  50.4  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  33.09 
 
 		 571 aa  50.4  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  22.48 
 
 		 547 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.59 
 
 		 544 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 121 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  19.14 
 
 		 547 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  30.77 
 
 		 149 aa  48.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 121 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 121 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 121 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  37.63 
 
 		 121 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  28.89 
 
 		 132 aa  47.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  37.63 
 
 		 121 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  31.19 
 
 		 124 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 697 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>