173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2472 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 210 aa  396  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  38.61 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  36.16 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  39.13 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  31.16 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  38.22 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  29.9 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  36.82 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  35.81 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  41.44 
 
 		 593 aa  74.7  0.0000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.46 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  35.59 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  36.72 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  38.03 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  40.6 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  41.48 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  46.46 
 
 		 244 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.72 
 
 		 217 aa  69.7  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  37.65 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  38.68 
 
 		 559 aa  68.9  0.00000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  30.7 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  34.45 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  34.45 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  34.45 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  38.18 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  37.1 
 
 		 124 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  34.72 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30.08 
 
 		 564 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.98 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  30.08 
 
 		 565 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  31.97 
 
 		 560 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  35.81 
 
 		 189 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  37.25 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  33.99 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  42.98 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  35.65 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  38.53 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  31.19 
 
 		 124 aa  62  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  33.52 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 513 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 122 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  22.76 
 
 		 549 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.67 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  34.82 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  24.64 
 
 		 544 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  24.64 
 
 		 544 aa  58.9  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  32.14 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  36.54 
 
 		 424 aa  58.5  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  35.29 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 605 aa  58.2  0.00000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  21.99 
 
 		 544 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  38.74 
 
 		 120 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  31.13 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  31.13 
 
 		 141 aa  57.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  33.98 
 
 		 122 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.71 
 
 		 590 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.06 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  32.76 
 
 		 124 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  34.65 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  24.63 
 
 		 547 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  36.36 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.55 
 
 		 869 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  23.26 
 
 		 547 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  23.88 
 
 		 547 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  32.08 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  24.63 
 
 		 544 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  34.38 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  35.09 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  24.63 
 
 		 549 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  35.09 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 120 aa  54.3  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 		 116 aa  54.3  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 613 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>