113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0381 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 211 aa  409  1e-113  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  65.32 
 
 		 206 aa  176  3e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  54.92 
 
 		 189 aa  131  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.56 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  38.76 
 
 		 188 aa  92  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  47.96 
 
 		 284 aa  92  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  39.64 
 
 		 226 aa  91.7  7e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  41.13 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.1 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  31.9 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  43.3 
 
 		 217 aa  77.4  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  37.19 
 
 		 241 aa  77.8  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  43.3 
 
 		 214 aa  73.9  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.32 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 424 aa  72.8  0.000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  38.35 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  39.33 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  36.32 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  38.67 
 
 		 564 aa  69.7  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  36.7 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  32.06 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  32.06 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.46 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  40.17 
 
 		 203 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  32.91 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  39.8 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 118 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  34.17 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.98 
 
 		 590 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  36.67 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  30.43 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  31.29 
 
 		 173 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  34.43 
 
 		 869 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  32.23 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  31.45 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  36.92 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  37.61 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.51 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.51 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5679  copper resistance protein CopC  35.56 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241881 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  27.69 
 
 		 549 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 559 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  38.78 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  37.76 
 
 		 131 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  35.71 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.48 
 
 		 544 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  35.48 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  34.02 
 
 		 265 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 126 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 126 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 126 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  37.27 
 
 		 528 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  27.87 
 
 		 544 aa  52.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  30.83 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  31.06 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  34.62 
 
 		 576 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.46 
 
 		 547 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  32.82 
 
 		 126 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  33.64 
 
 		 605 aa  52.4  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  33.85 
 
 		 124 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  27.05 
 
 		 547 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  26.24 
 
 		 547 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  35.64 
 
 		 146 aa  51.6  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  33.7 
 
 		 578 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  26.96 
 
 		 120 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  31.2 
 
 		 170 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  36.45 
 
 		 560 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  32.5 
 
 		 121 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  35.64 
 
 		 120 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  36.44 
 
 		 593 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  29.06 
 
 		 122 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  26.88 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  35.14 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  33.67 
 
 		 126 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  26.23 
 
 		 549 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  33.67 
 
 		 129 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  33.67 
 
 		 129 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  29.87 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  34.95 
 
 		 124 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  35.48 
 
 		 649 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 126 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  29.31 
 
 		 120 aa  47  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  26.96 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  34.34 
 
 		 519 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1977  hypothetical protein  29.23 
 
 		 117 aa  45.1  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 272 aa  45.1  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 132 aa  45.1  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  31.85 
 
 		 128 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  31.85 
 
 		 130 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  34.26 
 
 		 143 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>