157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4545 on replicon NC_009806
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 241 aa  444  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3575  copper resistance protein CopC  62.75 
 
 		 217 aa  112  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.310709  normal  0.0481479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  37 
 
 		 284 aa  97.1  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  41.05 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  37.3 
 
 		 208 aa  93.2  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.18 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  40.2 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  37.21 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.45 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  34.66 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  39.09 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  37.01 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  39.53 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  42.57 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 226 aa  75.1  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  42.59 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  40.71 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  36.55 
 
 		 173 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.18 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  41.9 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  44 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  31.91 
 
 		 198 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 174 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 		 124 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  32.87 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 174 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 174 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  32.26 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  34.95 
 
 		 124 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0381  copper resistance protein CopC  32.96 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 170 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  43.56 
 
 		 172 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  37.65 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.52 
 
 		 217 aa  64.3  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  36.08 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  36.08 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  36.08 
 
 		 126 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  42.98 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  38.64 
 
 		 576 aa  62.4  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  37.17 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  39.45 
 
 		 124 aa  62  0.000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  38.78 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  38.6 
 
 		 193 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  38.3 
 
 		 229 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  38.53 
 
 		 128 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  38.14 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 588 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  36.7 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  36.7 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  36.7 
 
 		 128 aa  60.5  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  39.45 
 
 		 559 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  35.96 
 
 		 539 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  40 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 590 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  38.94 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5210  copper resistance protein CopC  36.73 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  0.695526 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  37.89 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  37.89 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  37.89 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  36.7 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  39.45 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  33.87 
 
 		 697 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 128 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  36.54 
 
 		 149 aa  57.8  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  38.24 
 
 		 118 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  34.31 
 
 		 125 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  35.77 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0602  copper resistance protein CopC  39.02 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000550062 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  32.51 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  32.07 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  36.57 
 
 		 182 aa  57  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  37.89 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  37.25 
 
 		 125 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 127 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  34.4 
 
 		 126 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19140  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  40.4 
 
 		 227 aa  57  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.196545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  34.17 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  37.07 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  39.62 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.74 
 
 		 613 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  35.79 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  39.62 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  39.62 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  34.95 
 
 		 132 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  42.86 
 
 		 605 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  30.43 
 
 		 544 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  30.43 
 
 		 544 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  36.52 
 
 		 869 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  41.51 
 
 		 607 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 172 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 120 aa  53.5  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  42.45 
 
 		 551 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  35.11 
 
 		 131 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  34.04 
 
 		 139 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  30.7 
 
 		 544 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  33.64 
 
 		 513 aa  52.4  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  31.58 
 
 		 547 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>