90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2616 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 129 aa  254  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  56.73 
 
 		 125 aa  124  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  43.93 
 
 		 127 aa  94.7  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  45.79 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  41.8 
 
 		 126 aa  90.5  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  44.83 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  42.31 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  42.31 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  38.64 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  40.48 
 
 		 128 aa  84  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  41.51 
 
 		 132 aa  84.3  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  41.35 
 
 		 128 aa  84  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  42.5 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  43.4 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  40.38 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  39.81 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  38.46 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  40.48 
 
 		 122 aa  73.6  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  37.5 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  40.19 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  37.38 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  43.48 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  41.94 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  33.63 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  38.05 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  38.81 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  38.26 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  32.5 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  40.91 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  36.79 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  35.65 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  35.82 
 
 		 124 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  36.79 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  34.19 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  35.78 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  34.19 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  34.19 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  32.03 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  35.78 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  35.78 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  35.78 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  37.27 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  35.78 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  39.32 
 
 		 576 aa  53.9  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  35.45 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  36.44 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  32.33 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  36.9 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  32.54 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.9 
 
 		 869 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  32.76 
 
 		 539 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  32.08 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  30.56 
 
 		 277 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  32.08 
 
 		 126 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  32.08 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  31.75 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  31.75 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  34.29 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  32.2 
 
 		 424 aa  42.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  31.86 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  31.01 
 
 		 528 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  26.92 
 
 		 564 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  26.92 
 
 		 565 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 141 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 141 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  33.33 
 
 		 519 aa  41.2  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  29.55 
 
 		 226 aa  40.8  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4979  hypothetical protein  31.78 
 
 		 198 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  41.46 
 
 		 214 aa  40.4  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  28.44 
 
 		 206 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  31.01 
 
 		 199 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  37.1 
 
 		 170 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 590 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>