78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5773 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  100 
 
 
277 aa  545  1e-154  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5774  nuclear export factor GLE1  53.02 
 
 
265 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.659803  normal  0.786099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3433  hypothetical protein  41.42 
 
 
250 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000529758  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1125  nuclear export factor GLE1  41.24 
 
 
251 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3068  nuclear export factor GLE1  43.41 
 
 
253 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00699865  normal  0.0189877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4175  nuclear export factor GLE1  40.94 
 
 
237 aa  112  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.863338 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1014  nuclear export factor GLE1  35.42 
 
 
240 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0744443  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5783  nuclear export factor GLE1  36.87 
 
 
254 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1123  nuclear export factor GLE1  39.77 
 
 
247 aa  99.8  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551696  normal  0.615467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7242  nuclear export factor GLE1  40 
 
 
247 aa  98.6  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00784654  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3974  hypothetical protein  37.8 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113102  normal  0.378108 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4535  nuclear export factor GLE1  34.16 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.540264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0320  nuclear export factor GLE1  37.34 
 
 
251 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0856578  normal  0.260311 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1866  nuclear export factor GLE1  35.71 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0919019  normal  0.129398 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1732  hypothetical protein  29.33 
 
 
206 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.125405  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1950  hypothetical protein  29.33 
 
 
206 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000255275 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1754  hypothetical protein  29.33 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.14919  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1998  hypothetical protein  31.65 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.312999  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1787  nuclear export factor GLE1  29.81 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00148797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3425  hypothetical protein  28.85 
 
 
206 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000164517 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1775  hypothetical protein  28.85 
 
 
206 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.148709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1913  hypothetical protein  28.85 
 
 
206 aa  79  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0628905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1918  hypothetical protein  28.37 
 
 
206 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0347676  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2019  hypothetical protein  28.37 
 
 
206 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000214878  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2199  nuclear export factor GLE1  30.77 
 
 
177 aa  75.1  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.129835  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0042  nuclear export factor GLE1  33.14 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2425  nuclear export factor GLE1  33.12 
 
 
180 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0453347  normal  0.0660854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1159  nuclear export factor GLE1  34.36 
 
 
233 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1276  nuclear export factor GLE1  33.75 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0739832  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0170  nuclear export factor GLE1  31.25 
 
 
184 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0678935  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0754  nuclear export factor GLE1  32.52 
 
 
245 aa  67  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0129981 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1513  nuclear export factor GLE1  32.62 
 
 
196 aa  65.1  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.233853  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0133  nuclear export factor GLE1  29.94 
 
 
175 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0421981 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3278  nuclear export factor GLE1  30.92 
 
 
176 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00610  hypothetical protein  32.57 
 
 
230 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0768346  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2595  nuclear export factor GLE1  30.32 
 
 
176 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.258985  normal  0.553728 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0627  nuclear export factor GLE1  31.85 
 
 
264 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0054  hypothetical protein  28.73 
 
 
334 aa  60.8  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0054  hypothetical protein  28.73 
 
 
351 aa  60.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0058  hypothetical protein  30.11 
 
 
342 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2625  nuclear export factor GLE1  32.45 
 
 
220 aa  58.9  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4675  nuclear export factor GLE1  31.61 
 
 
166 aa  56.2  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.533888  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1373  protein of unknown function DUF461  30.3 
 
 
357 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0110543  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1066  nuclear export factor GLE1  28.57 
 
 
243 aa  56.2  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.614855  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2089  protein of unknown function DUF461  28.02 
 
 
337 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  normal  0.321233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0807  nuclear export factor GLE1  27.81 
 
 
178 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.228127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1887  nuclear export factor GLE1  24.88 
 
 
338 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.145629  normal  0.0275179 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0384  hypothetical protein  27.01 
 
 
320 aa  53.1  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1186  hypothetical protein  26.67 
 
 
327 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.213641 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1378  hypothetical protein  27.12 
 
 
365 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0591071  decreased coverage  0.00000407941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3108  hypothetical protein  28.12 
 
 
323 aa  49.7  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.210099  normal  0.0486377 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1653  protein of unknown function DUF461  26.55 
 
 
357 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.494454  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0925  nuclear export factor GLE1  28.4 
 
 
150 aa  48.1  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.225489 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5301  protein of unknown function DUF461  27.78 
 
 
319 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  34.58 
 
 
126 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5371  hypothetical protein  28.24 
 
 
324 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.657374  normal  0.0321258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5608  nuclear export factor GLE1 domain-containing protein  26.39 
 
 
321 aa  46.6  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.514484 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 
172 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  33.98 
 
 
173 aa  45.8  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  30 
 
 
125 aa  45.4  0.0009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  33.96 
 
 
173 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  29.17 
 
 
120 aa  45.4  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  31.48 
 
 
124 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  29.36 
 
 
127 aa  44.3  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1762  nuclear export factor GLE1  27.19 
 
 
176 aa  44.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.101403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  30.56 
 
 
129 aa  43.5  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  34.69 
 
 
226 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 
128 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 
128 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4773  protein of unknown function DUF461  32.43 
 
 
302 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.917664  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 
160 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 
124 aa  42.7  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  27.78 
 
 
128 aa  42.7  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 
128 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 
128 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 
128 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 
128 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  30.84 
 
 
128 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>