78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2425 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  60.71 
 
 		 127 aa  148  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  49.51 
 
 		 125 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  43.69 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  42.64 
 
 		 130 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  45.79 
 
 		 129 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  45.63 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  45.63 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  42.72 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  43.69 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  41.6 
 
 		 128 aa  88.2  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  39.42 
 
 		 132 aa  87  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  43.27 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  40.19 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  36.8 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  36.8 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  43.86 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  43.4 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  42.45 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  40.18 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  35.78 
 
 		 125 aa  72  0.000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  39.52 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  35.54 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  31.62 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  33.88 
 
 		 173 aa  53.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  29.06 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  36.07 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  34.51 
 
 		 125 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  33.08 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  29.91 
 
 		 547 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  33.93 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  31.36 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  30.09 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  34.48 
 
 		 869 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  29.06 
 
 		 544 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  29.06 
 
 		 544 aa  47.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  29.91 
 
 		 547 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  28.21 
 
 		 544 aa  47  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  29.66 
 
 		 549 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  28.35 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.82 
 
 		 549 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  29.81 
 
 		 225 aa  45.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 118 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  28.69 
 
 		 277 aa  44.7  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  33.96 
 
 		 284 aa  44.7  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  28.07 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  28.95 
 
 		 544 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  29.06 
 
 		 120 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  28.83 
 
 		 210 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  28.81 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  32.48 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  29.69 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  34.17 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  28.23 
 
 		 121 aa  42.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  26.72 
 
 		 528 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  31.13 
 
 		 265 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  28.16 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  30 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  29.85 
 
 		 206 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  27.97 
 
 		 547 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  30.28 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  28.46 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4019  copper resistance protein CopC  32.73 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 241 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  30.09 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  28.1 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  27.83 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  27.83 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  27.83 
 
 		 124 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>