95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5431 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5431  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 106 aa  211  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.199707 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4019  copper resistance protein CopC  46.94 
 
 		 122 aa  87  8e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 		 571 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  32.17 
 
 		 547 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  31.19 
 
 		 544 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  32.17 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  31.19 
 
 		 544 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  33.01 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  33.01 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  31.3 
 
 		 549 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  32.38 
 
 		 146 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  33.01 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  32.32 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  32.32 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  31.3 
 
 		 547 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  30.28 
 
 		 549 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  30.28 
 
 		 544 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  29.36 
 
 		 547 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  32.38 
 
 		 119 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  31.73 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  31.73 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  31.73 
 
 		 128 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  28.71 
 
 		 210 aa  51.2  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  32.73 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  31.37 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  31.37 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  29.2 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  31.68 
 
 		 137 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  30.3 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  29.9 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  31.37 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  31.37 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  31.37 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  28.43 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  29.9 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  25.96 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  25.96 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  30.56 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  30.48 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  30.48 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  30.48 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2624  copper resistance protein CopC  29.7 
 
 		 546 aa  47  0.00008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  30.39 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 241 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  34.91 
 
 		 588 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  29.52 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  28.18 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  28 
 
 		 184 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  28.18 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  29.13 
 
 		 214 aa  45.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  31.63 
 
 		 208 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0808  hypothetical protein  28.85 
 
 		 126 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.107566  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  28.04 
 
 		 869 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.78 
 
 		 208 aa  43.9  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 160 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  26.55 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  30.63 
 
 		 125 aa  42.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 118 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  26.55 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  26.55 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  28.71 
 
 		 284 aa  43.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  29 
 
 		 590 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  27.03 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  33.66 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  28.28 
 
 		 197 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  28.42 
 
 		 578 aa  41.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  25.24 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  29.9 
 
 		 265 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  31.78 
 
 		 178 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  25.71 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  25.77 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  26.42 
 
 		 188 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  25.71 
 
 		 140 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  28.81 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  26.42 
 
 		 226 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  48.39 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  25.45 
 
 		 613 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  26.73 
 
 		 560 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  29.09 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  27.36 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  32.32 
 
 		 206 aa  40.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  26.92 
 
 		 226 aa  40.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  31 
 
 		 196 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  30.39 
 
 		 207 aa  40  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>