110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp0658 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  100 
 
 		 128 aa  256  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  66.67 
 
 		 132 aa  162  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  66.94 
 
 		 128 aa  161  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1721  copper resistance protein CopC  64.06 
 
 		 128 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  63.28 
 
 		 128 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5338  copper resistance protein CopC  64.06 
 
 		 128 aa  157  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5669  copper resistance protein C  68.93 
 
 		 128 aa  153  9e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  66.99 
 
 		 128 aa  151  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  60.8 
 
 		 126 aa  149  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5117  copper resistance protein CopC  66.02 
 
 		 128 aa  148  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.834452  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1838  copper resistance protein CopC  69.37 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.413816  hitchhiker  0.0000522971 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5102  copper resistance protein CopC  68.47 
 
 		 128 aa  145  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0403069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  56.45 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  53.85 
 
 		 130 aa  135  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1716  copper resistance protein CopC  54.47 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.200114  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5333  copper resistance protein CopC  54.47 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.726356 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  56.07 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2925  copper resistance protein CopC  50.49 
 
 		 125 aa  99.4  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2140  copper resistance protein CopC  41.12 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.392033  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2425  copper resistance protein CopC  42.99 
 
 		 127 aa  87  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2616  copper resistance protein CopC  43.52 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.815455 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0115  copper resistance protein C  38.84 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  38.53 
 
 		 125 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  36.28 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3446  copper resistance protein CopC  40.17 
 
 		 120 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  35.38 
 
 		 125 aa  67  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  32.54 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  41.18 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  41.88 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  38.14 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  32.31 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  32.31 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  33.91 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  33.91 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 111 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  33.91 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  33.91 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  32.31 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  39.17 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  41.51 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  33.04 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.52 
 
 		 590 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  32.74 
 
 		 124 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  37.7 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  32.17 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6630  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  32.74 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  32.74 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  36.7 
 
 		 146 aa  52.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  33.33 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  33.85 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2084  putative cation resistance protein, CopC-like  36.7 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2412  hypothetical protein  34.52 
 
 		 124 aa  50.4  0.000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 		 241 aa  50.4  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  36.45 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  32.8 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  36.45 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  36.45 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  39.25 
 
 		 225 aa  48.5  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 613 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  33.96 
 
 		 539 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  35.45 
 
 		 120 aa  46.2  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2762  copper resistance protein CopC  34.29 
 
 		 126 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  32.46 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  34.29 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  34.29 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  33.03 
 
 		 593 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  32.41 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  32.41 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  32.41 
 
 		 174 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2173  copper resistance protein CopC  37.08 
 
 		 130 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  28.1 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  34.68 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  31.94 
 
 		 120 aa  43.9  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  28.46 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  34.68 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.52 
 
 		 564 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.52 
 
 		 565 aa  43.9  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  37.17 
 
 		 272 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  31.67 
 
 		 208 aa  43.5  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 869 aa  43.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4398  copper resistance protein CopC  30.89 
 
 		 118 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  34.68 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1207  copper resistance protein CopC  27.68 
 
 		 121 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  34.15 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  34.96 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  28.33 
 
 		 559 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  24.62 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  31.06 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  31.67 
 
 		 122 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  31.93 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  33.59 
 
 		 172 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1501  copper resistance protein CopC  29.32 
 
 		 172 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.456265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2223  copper resistance protein CopC  34.33 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.213465 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>