78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2223 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2223  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 122 aa  251  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.213465 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  68.47 
 
 		 120 aa  169  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1207  copper resistance protein CopC  49.04 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  28.95 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 564 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  33.04 
 
 		 565 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  28.46 
 
 		 124 aa  52  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  28.23 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  34.55 
 
 		 208 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  29.77 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4545  copper resistance protein CopC  33 
 
 		 241 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  26.02 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  26.02 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  26.02 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  26.89 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  33.33 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  28.23 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1429  copper resistance protein CopC  25.23 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  28.23 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11740  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  33.33 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.245018  normal  0.434498 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  30.51 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  27.27 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  27.27 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  28.69 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  28 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  27.27 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  32.76 
 
 		 210 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  28.69 
 
 		 121 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  30.19 
 
 		 214 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  28.69 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  27.05 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.69 
 
 		 233 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  33.91 
 
 		 189 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  28.69 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2054  copper resistance protein CopC  58.06 
 
 		 193 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00250469  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  27.87 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3414  copper resistance protein CopC  28.24 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  29.09 
 
 		 174 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 588 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 560 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 244 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  28.44 
 
 		 869 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  30.5 
 
 		 697 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  34 
 
 		 284 aa  45.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  26.45 
 
 		 121 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6114  copper resistance protein CopC  29.69 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00881614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  28.44 
 
 		 613 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  29.57 
 
 		 590 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36820  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  30.17 
 
 		 217 aa  44.3  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00403371  normal  0.543816 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2238  copper resistance protein CopC  29.31 
 
 		 126 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  31.4 
 
 		 632 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  26.72 
 
 		 124 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4266  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 203 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0318139  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0445  copper resistance protein CopC  25.58 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2634  copper resistance protein CopC  27.59 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  21.24 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  28.04 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  28.71 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  23.48 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  21.24 
 
 		 140 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  28.3 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  21.24 
 
 		 140 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5773  nuclear export factor GLE1  26.8 
 
 		 277 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.993816  normal  0.797984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  29.73 
 
 		 184 aa  41.2  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1495  copper resistance protein CopC  28.03 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.594535  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  30.17 
 
 		 197 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2340  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  0.896409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2347  copper resistance protein CopC  28.46 
 
 		 122 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2571  conserved hypothetical protein containing Cu resistance protein-like domain  26.36 
 
 		 199 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.6378 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  28.1 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  25.71 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  24.53 
 
 		 160 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  28.57 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  25.78 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>