57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1207 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1207  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 121 aa  247  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  47.17 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2223  copper resistance protein CopC  48.39 
 
 		 122 aa  98.6  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.213465 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2276  copper resistance protein CopC  33.63 
 
 		 124 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2706  copper resistance protein CopC  31.63 
 
 		 121 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  24.79 
 
 		 132 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  30.63 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.48 
 
 		 564 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5052  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5140  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 174 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.184772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5431  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 174 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656752  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  33.62 
 
 		 565 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  29.73 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  29.27 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2576  hypothetical protein  25.81 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.696222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1374  hypothetical protein  26.17 
 
 		 124 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000509371 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  27.93 
 
 		 590 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2089  hypothetical protein  26.17 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.602159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2472  copper resistance protein CopC  28.18 
 
 		 210 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2034  hypothetical protein  26.17 
 
 		 124 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00388  putative copper resistance (CopC-like) protein  28.7 
 
 		 117 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  26.36 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  25 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  24.8 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  25 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2029  hypothetical protein  26.17 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.954375  normal  0.546121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  24.59 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1249  hypothetical protein  26.17 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.908589  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  26.55 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  25 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  30 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  33 
 
 		 210 aa  43.5  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  25 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  24.59 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  24.8 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  24.59 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  26.61 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  23.44 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  27.55 
 
 		 121 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  27.55 
 
 		 121 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  26.09 
 
 		 121 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0658  copper resistance C signal peptide protein  36.36 
 
 		 128 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  27.84 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  28.32 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  26.53 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  27.84 
 
 		 139 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  26.52 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  24.17 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  26.52 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2487  copper resistance protein CopC  48.48 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.484808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 244 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2070  hypothetical protein  24.19 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  26.98 
 
 		 197 aa  40.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1777  copper resistance protein CopC  31.82 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.127324  normal  0.175952 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  25.83 
 
 		 178 aa  40.4  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  27.52 
 
 		 613 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>