58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00388 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00388  putative copper resistance (CopC-like) protein  100 
 
 		 117 aa  236  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  37.14 
 
 		 149 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  35.04 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  33.65 
 
 		 132 aa  73.9  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1743  copper resistance protein CopC  27.35 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.112709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  31.43 
 
 		 590 aa  52  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1977  hypothetical protein  25.96 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1623  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.588237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2437  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2339  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.221588  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3473  copper resistance protein CopC  30.43 
 
 		 122 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0671565  normal  0.436701 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  29.57 
 
 		 125 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  32.26 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  31.19 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  32.61 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0468  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2761  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.425917  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2321  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.539083  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  30.39 
 
 		 539 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1943  copper resistance protein CopC  28.7 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00257341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  32.74 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 		 124 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1742  copper resistance protein CopC  28.23 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  32.41 
 
 		 196 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1207  copper resistance protein CopC  28.7 
 
 		 121 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5304  copper resistance protein CopC  27.62 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.949952  normal  0.102582 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4983  copper resistance protein CopC  27.62 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.118695  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0430  copper resistance protein CopC  30.7 
 
 		 160 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550778  normal  0.772452 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3384  copper resistance protein CopC  27.62 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.63 
 
 		 613 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4214  Cu resistance protein  30.7 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.149381  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1243  copper resistance protein CopC  24.14 
 
 		 206 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  0.0232634 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0694  copper resistance protein CopC  25.93 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.57317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  32.04 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0716  putative copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180787  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0624  putative copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.793575  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2011  hypothetical protein  30.61 
 
 		 126 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5192  copper resistance protein CopC  28 
 
 		 131 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  31.73 
 
 		 120 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1346  hypothetical protein  26.02 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331332 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4407  copper resistance protein CopC  27.55 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  26.73 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4926  copper resistance protein CopC  26.53 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0497  copper resistance protein CopC  28.85 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3355  copper resistance protein CopC  27 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.67 
 
 		 233 aa  40.4  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4271  copper resistance protein CopC  27.69 
 
 		 122 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.153975 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2116  hypothetical protein  25.81 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  28.33 
 
 		 564 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  28.33 
 
 		 565 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01812  hypothetical protein  25.81 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01800  hypothetical protein  25.81 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1801  copper resistance protein CopC  25.81 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.546063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1791  hypothetical protein  25.81 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.983023  normal  0.0962251 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1932  hypothetical protein  25.81 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>