18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_1977 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_1977  hypothetical protein  100 
 
 		 117 aa  245  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1388  copper resistance protein CopC  29.91 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  28.93 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  26.32 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00388  putative copper resistance (CopC-like) protein  25.96 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  25.44 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  25.44 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3544  copper resistance protein CopC  23.36 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0711776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  28.33 
 
 		 188 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6289  copper resistance protein CopC  26.27 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.202962 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1957  copper resistance protein, putative  27.78 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3812  copper resistance protein CopC  29.1 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.994582  normal  0.824411 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2038  copper resistance protein CopC  26.17 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.873507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1238  copper resistance protein CopC  26.67 
 
 		 124 aa  42.4  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.669517  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  26.89 
 
 		 571 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.36 
 
 		 613 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2514  copper resistance protein CopC  26.47 
 
 		 120 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  27.35 
 
 		 172 aa  40  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>