11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2830 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2830  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  288  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000108966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2772  hypothetical protein  88.89 
 
 		 149 aa  241  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0593  hypothetical protein  42.36 
 
 		 143 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.650029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3522  hypothetical protein  39.1 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  29.5 
 
 		 236 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  31.94 
 
 		 270 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  28.28 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  27.78 
 
 		 164 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  32.45 
 
 		 165 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  28.77 
 
 		 160 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  27.97 
 
 		 162 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>