54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2708 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  66.86 
 
 
173 aa  244  4e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  58.14 
 
 
180 aa  222  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3895  hypothetical protein  62.13 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1447  hypothetical protein  52.26 
 
 
159 aa  165  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  43.95 
 
 
175 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1387  membrane protein  46.85 
 
 
195 aa  136  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2915  hypothetical protein  45 
 
 
154 aa  131  5e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0258  hypothetical protein  44.29 
 
 
153 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11160  hypothetical protein  38.22 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  39.58 
 
 
170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0157  hypothetical protein  33.96 
 
 
160 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.486831  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2316  hypothetical protein  33.33 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3826  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.492638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01474  membrane protein-like protein  38.41 
 
 
156 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3848  hypothetical protein  33.96 
 
 
160 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0429  hypothetical protein  40.43 
 
 
151 aa  101  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.055069  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2265  membrane protein-like protein  38.51 
 
 
152 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.560629  normal  0.0217418 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1782  hypothetical protein  39.72 
 
 
151 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.811236  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4757  hypothetical protein  38.26 
 
 
149 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.13862  normal  0.0394716 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  32.86 
 
 
153 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  34.42 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  33.77 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  33.77 
 
 
185 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  36.05 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  38.85 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.06 
 
 
277 aa  68.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  30.28 
 
 
270 aa  68.6  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  29.08 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  37.86 
 
 
173 aa  61.6  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5656  hypothetical protein  44.57 
 
 
102 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6294  hypothetical protein  33.78 
 
 
162 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.47453  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5607  hypothetical protein  34.55 
 
 
145 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000835416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  27.21 
 
 
171 aa  57.4  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20170  hypothetical protein  37 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0976183  normal  0.0396109 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  30.38 
 
 
189 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  31.21 
 
 
168 aa  51.6  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1786  hypothetical protein  32.26 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.913708  hitchhiker  0.00540789 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2828  hypothetical protein  29.17 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2570  membrane protein-like  26.03 
 
 
185 aa  50.1  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0270  hypothetical protein  28.47 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0260  hypothetical protein  28.47 
 
 
189 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.075822  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0250  hypothetical protein  28.47 
 
 
189 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3614  hypothetical protein  29.08 
 
 
142 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.66214  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.18 
 
 
296 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  28.47 
 
 
315 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3111  hypothetical protein  28.69 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2301  hypothetical protein  28.17 
 
 
142 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.576316  normal  0.759333 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  26.52 
 
 
236 aa  42.4  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3688  hypothetical protein  26.45 
 
 
142 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.292524  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  29.85 
 
 
189 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  32.22 
 
 
293 aa  41.6  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1919  hypothetical protein  27.13 
 
 
221 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.90171  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1302  hypothetical protein  27.73 
 
 
289 aa  40.8  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>