80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1529 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1529  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 		 209 aa  422  1e-117  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00138894  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1423  hypothetical protein  34.65 
 
 		 155 aa  84.7  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1146  hypothetical protein  35.43 
 
 		 154 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0081  hypothetical protein  32.28 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0912  hypothetical protein  32.81 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.680644 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1157  hypothetical protein  32.28 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00145617  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0103  hypothetical protein  31.5 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.1185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2394  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.67 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00571453  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0081  rubrerythrin  61.11 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2054  putative flavoprotein  63.64 
 
 		 884 aa  58.2  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0448617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3241  hypothetical protein  57.14 
 
 		 36 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000312443  hitchhiker  0.0015976 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0063  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.66 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3496  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.67 
 
 		 520 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  57.14 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3816  rubrerythrin  55.88 
 
 		 180 aa  52.4  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000477508  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0902  Rubrerythrin  52.63 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00197939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0588  rubrerythrin  46.15 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0681  rubredoxin/rubrerythrin  44.44 
 
 		 180 aa  48.9  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1856  ruberythrin-like  50 
 
 		 39 aa  48.9  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406851  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0077  rubredoxin/rubrerythrin  47.37 
 
 		 180 aa  48.9  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165154  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2955  rubredoxin/rubrerythrin  47.37 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00806345  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0099  rubrerythrin  47.37 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0220347  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2638  rubrerythrin  47.37 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000156836  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0878  Rubrerythrin  62.96 
 
 		 168 aa  48.5  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000000346492  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  48.57 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  51.35 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2460  NAD(FAD)-dependent dehydrogenase or nitrite reductase  55.17 
 
 		 501 aa  48.5  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000440664  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  40 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0682  rubredoxin/rubrerythrin  47.22 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0199  ferredoxin-thioredoxin reductase, catalytic subunit, putative/rubredoxin  53.33 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000596117  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1091  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  55.88 
 
 		 878 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.224862  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.41 
 
 		 111 aa  47  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1269  rubredoxin/flavodoxin/oxidoreductase  55.88 
 
 		 878 aa  47.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0154  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 		 167 aa  46.6  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00592628  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  45.71 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2901  hypothetical protein  26.92 
 
 		 149 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  41.67 
 
 		 179 aa  45.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1259  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.55 
 
 		 109 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.790235 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.22 
 
 		 51 aa  45.4  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  47.37 
 
 		 180 aa  45.4  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19080  Rubrerythrin  54.84 
 
 		 185 aa  45.4  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00100041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4567  Rubrerythrin  43.59 
 
 		 181 aa  45.1  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.02567e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1606  rubrerythrin  46.67 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0475668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3563  rubrerythrin  67.86 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.381154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0927  putative ferredoxin-thioredoxin reductase,catalyticsubunit  48.28 
 
 		 167 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.091769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  63.64 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  46.67 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  41.67 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  48.57 
 
 		 178 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  45.71 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  63.64 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0907  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.67 
 
 		 163 aa  43.5  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000583503  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0916  rubrerythrin  46.88 
 
 		 165 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  51.72 
 
 		 179 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  46.67 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  53.33 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3227  cytochrome b5  24.44 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.852192 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4691  rubrerythrin-like  32.89 
 
 		 143 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.806992  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  55.17 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_187  rubredoxin-type iron-sulfur protein  50 
 
 		 168 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000349376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  56.52 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  55.17 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  55.17 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1320  rubrerythrin, putative  46.88 
 
 		 165 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000383486  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  48.28 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  40 
 
 		 190 aa  42  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2432  rubredoxin  50 
 
 		 167 aa  42  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000792123  normal  0.129833 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  51.72 
 
 		 190 aa  42  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  59.09 
 
 		 191 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1646  Rubrerythrin  46.88 
 
 		 165 aa  42  0.007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  48.15 
 
 		 172 aa  42  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1632  rubrerythrin  56.67 
 
 		 169 aa  42  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.368891  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2197  Rubrerythrin  50 
 
 		 166 aa  41.6  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0082  rubrerythrin  57.58 
 
 		 167 aa  41.6  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1891  rubrerythrin  57.14 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.395956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  51.61 
 
 		 181 aa  41.6  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3363  hypothetical protein  47.06 
 
 		 83 aa  41.6  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  37.14 
 
 		 190 aa  41.6  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  40 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0768  rubredoxin  43.14 
 
 		 53 aa  41.2  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>